219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1324 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1324  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant  100 
 
 
190 aa  398  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1596  Peroxiredoxin  76.84 
 
 
190 aa  316  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.238249 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08311  peroxiredoxin  70.53 
 
 
190 aa  295  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1368  redoxin domain-containing protein  70.69 
 
 
175 aa  276  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0376833 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0162  redoxin  67.91 
 
 
189 aa  275  3e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.648171  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3040  redoxin domain-containing protein  70.69 
 
 
176 aa  275  4e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.825504  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1893  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  70.76 
 
 
175 aa  270  9e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248351  normal  0.171971 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6651  Redoxin domain protein  69.64 
 
 
189 aa  263  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.377378  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3890  peroxiredoxin  67.25 
 
 
174 aa  261  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2381  peroxiredoxin  62.5 
 
 
179 aa  237  6.999999999999999e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.535734  normal  0.175028 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1176  putative peroxiredoxin  60.71 
 
 
175 aa  232  2.0000000000000002e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0424776  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3473  hypothetical protein  60.71 
 
 
179 aa  229  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0016  redoxin domain-containing protein  56.59 
 
 
184 aa  220  8e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276317  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3596  redoxin  56.9 
 
 
181 aa  218  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.723632 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5199  redoxin domain-containing protein  57.74 
 
 
179 aa  214  5e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271736  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  58.01 
 
 
259 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1377  redoxin domain-containing protein  52.75 
 
 
188 aa  214  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2781  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  55.69 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1423  redoxin domain-containing protein  55.69 
 
 
182 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.179376  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4981  glutaredoxin-like region  59.64 
 
 
251 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3338  glutaredoxin family protein  59.64 
 
 
247 aa  207  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280994  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  58.14 
 
 
248 aa  205  3e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  58.43 
 
 
243 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  58.43 
 
 
243 aa  204  5e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  56.63 
 
 
243 aa  204  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  55.62 
 
 
242 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  56.47 
 
 
247 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2508  glutaredoxin-family domain protein  59.04 
 
 
245 aa  202  2e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  56.47 
 
 
247 aa  202  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  53.63 
 
 
243 aa  203  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2464  glutaredoxin family protein  56.32 
 
 
248 aa  201  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.282108 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1224  glutaredoxin family protein  56.32 
 
 
248 aa  201  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.59398  normal  0.0783032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3472  glutaredoxin family protein  55 
 
 
243 aa  200  9e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.99974  normal  0.318929 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  58.43 
 
 
247 aa  200  9.999999999999999e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  56.29 
 
 
238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  56.29 
 
 
243 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  54.44 
 
 
242 aa  198  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  57.23 
 
 
247 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  57.56 
 
 
249 aa  198  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  55.81 
 
 
242 aa  198  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  58.14 
 
 
249 aa  197  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  53.93 
 
 
242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  56.89 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  56.89 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  56.89 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  56.47 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  53.76 
 
 
246 aa  194  6e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  54.82 
 
 
245 aa  192  3e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22388  peroxiredoxin  53.59 
 
 
233 aa  187  8e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0356  redoxin  45.61 
 
 
159 aa  150  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3464  Redoxin domain protein  46.2 
 
 
167 aa  148  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00011215  hitchhiker  0.000691326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0492  type 2 peroxiredoxin AhpC/TSAfamily  46.2 
 
 
167 aa  147  9e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000163064  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4903  Redoxin domain protein  44.57 
 
 
168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1274  redoxin domain-containing protein  52.48 
 
 
168 aa  146  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125392  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5126  Redoxin domain protein  49.66 
 
 
162 aa  145  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2830  redoxin domain-containing protein  44.51 
 
 
168 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000266084  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2667  redoxin domain-containing protein  50.71 
 
 
169 aa  144  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000181352  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0683  redoxin domain-containing protein  49.65 
 
 
162 aa  144  9e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.804383  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00160  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  49.3 
 
 
157 aa  143  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3651  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.12 
 
 
168 aa  143  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000135148  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3513  anti-oxidant AhpCTSA family protein  50.36 
 
 
157 aa  142  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0173  redoxin domain-containing protein  50.71 
 
 
166 aa  142  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136902  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0083  redoxin  43.35 
 
 
168 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000103454  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0565  redoxin domain-containing protein  43.35 
 
 
168 aa  142  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0157246  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0266  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.37 
 
 
168 aa  142  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.25 
 
 
168 aa  142  4e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.92238  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0348  redoxin domain-containing protein  49.28 
 
 
168 aa  142  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.828163  decreased coverage  0.000328891 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3541  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.79 
 
 
157 aa  141  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.29568  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0536  redoxin domain-containing protein  43.35 
 
 
168 aa  141  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397441  normal  0.710427 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2855  antioxidant, AhpC/Tsa family protein  50 
 
 
157 aa  140  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0469  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0173332  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0213  redoxin domain-containing protein  50 
 
 
168 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.15886 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2544  AhpC/TSA family protein  47.86 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3538  AhpC/TSA family protein  47.86 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2004  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.61 
 
 
159 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187894  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3989  redoxin domain-containing protein  51.88 
 
 
168 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000343004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3814  redoxin domain-containing protein  49.28 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.632392  normal  0.0206857 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3905  redoxin domain-containing protein  49.28 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.105906  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4020  redoxin domain-containing protein  49.28 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0465  AhpC/TSA family protein  47.86 
 
 
214 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490707  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1324  AhpC/TSA family protein  47.86 
 
 
190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3519  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.86 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.961154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3544  anti-oxidant AhpCTSA family protein  47.86 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3239  AhpC/TSA family protein  47.86 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0494  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570161  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4640  anti-oxidant AhpCTSA family protein  49.28 
 
 
158 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3849  redoxin domain-containing protein  42.01 
 
 
157 aa  139  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1124  AhpC/TSA family protein  47.14 
 
 
185 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3785  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  48.91 
 
 
183 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.144432  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0166  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.53 
 
 
167 aa  138  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.566279  normal  0.318936 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1905  redoxin domain-containing protein  45.58 
 
 
161 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441559  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2670  redoxin domain-containing protein  44.71 
 
 
160 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.656448  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0215  redoxin domain-containing protein  42.6 
 
 
157 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0187  Redoxin domain protein  46.43 
 
 
166 aa  137  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000633793  normal  0.64973 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0283  Redoxin domain protein  46.1 
 
 
168 aa  137  1e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00098707  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0288  redoxin domain-containing protein  46.1 
 
 
185 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039073 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2973  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  43.5 
 
 
168 aa  136  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00621825  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3218  redoxin domain-containing protein  48.18 
 
 
167 aa  136  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0848811  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0401  redoxin domain-containing protein  46.41 
 
 
192 aa  136  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3641  redoxin domain-containing protein  48.2 
 
 
178 aa  136  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.731441  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>