282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0829 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0829  glutaredoxin  100 
 
 		 80 aa  166  9e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0519  glutaredoxin GrxC  53.62 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0296  glutaredoxin GrxC  45.57 
 
 		 86 aa  76.6  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  53.16 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2509  glutaredoxin 3  51.43 
 
 		 85 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.281464  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0602  glutaredoxin 3  52.17 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  53.16 
 
 		 85 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1029  glutaredoxin 3  50 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2903  glutaredoxin GrxC  51.43 
 
 		 85 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.844851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2714  glutaredoxin 3  46.38 
 
 		 84 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2958  glutaredoxin  46.38 
 
 		 84 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0186705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0025  glutaredoxin GrxC  52.17 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7595  glutaredoxin 3  52.17 
 
 		 90 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0365143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0940  glutaredoxin 3  41.03 
 
 		 84 aa  73.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0106  glutaredoxin GrxC  50.72 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  53.62 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3005  glutaredoxin 3  51.32 
 
 		 93 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2263  glutaredoxin 3  46.84 
 
 		 85 aa  72  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0554842  normal  0.925585 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3507  glutaredoxin-3  46.84 
 
 		 85 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.838286 
 
 
-
 
NC_004310  BR1876  glutaredoxin 3  46.67 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1807  glutaredoxin 3  46.67 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.433283  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3239  glutaredoxin 3  47.83 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3531  glutaredoxin 3  50.7 
 
 		 85 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182347  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3822  glutaredoxin 3  49.3 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  48.57 
 
 		 86 aa  70.1  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  49.3 
 
 		 85 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  46.84 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0237  glutaredoxin 3  46.15 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  46.84 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  52.86 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  40.51 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  46.38 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3969  glutaredoxin 3  44.93 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0325  glutaredoxin 3  40.51 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.193454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00542  glutaredoxin 3 GrxC  41.89 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1464  glutaredoxin 3  48.65 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01971  glutaredoxin  47.14 
 
 		 84 aa  63.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  44.29 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3300  glutaredoxin 3  42.03 
 
 		 85 aa  62  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3613  glutaredoxin 3  45.57 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842003  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  37.84 
 
 		 112 aa  62  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3089  glutaredoxin 3  44.44 
 
 		 84 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.393298  normal  0.343511 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  44.16 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  42.86 
 
 		 81 aa  61.2  0.000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  41.77 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  42.03 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1905  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 86 aa  60.5  0.000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3690  glutaredoxin 3  45.07 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.059145 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  39.44 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  41.43 
 
 		 87 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  45.71 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  41.18 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0127  glutaredoxin 3  39.24 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.243764  normal  0.0245939 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  42.67 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1790  glutaredoxin 3  38.81 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  42.67 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  40.58 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4389  glutaredoxin  40.24 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0033  glutaredoxin GrxC  39.19 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  38.57 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  39.13 
 
 		 83 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  42.25 
 
 		 110 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  42.03 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  39.51 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2122  glutaredoxin GrxC  44.29 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  39.51 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  37.18 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2019  glutaredoxin GrxC  43.06 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.908829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0536  glutaredoxin 3  40 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4179  putative glutaredoxin 3  40 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0252  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 85 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1402  glutaredoxin 3  40.54 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  37.31 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  41.43 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0306  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1944  glutaredoxin 3  41.67 
 
 		 87 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.30403  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  38.57 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0181  glutaredoxin GrxC  40.26 
 
 		 84 aa  55.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  37.68 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0211  glutaredoxin 3  38.57 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.154177 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1737  glutaredoxin 3  44.29 
 
 		 85 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4078  glutaredoxin 3  42.03 
 
 		 105 aa  56.2  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000378056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3218  glutaredoxin  36.76 
 
 		 395 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0230  glutaredoxin 3  38.57 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.53184  hitchhiker  0.00238728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  38.46 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>