150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2661 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 		 219 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  65.58 
 
 		 244 aa  303  9.000000000000001e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  60.67 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  63.96 
 
 		 227 aa  290  9e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.28 
 
 		 215 aa  240  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  53.3 
 
 		 242 aa  229  3e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  53.81 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  55.07 
 
 		 205 aa  225  3e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  54.55 
 
 		 218 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  50 
 
 		 217 aa  221  8e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.44 
 
 		 218 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  52.86 
 
 		 239 aa  219  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  52.83 
 
 		 213 aa  218  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 		 225 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.4 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  53.3 
 
 		 194 aa  207  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  46.01 
 
 		 216 aa  207  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.8 
 
 		 218 aa  206  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.64 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  47 
 
 		 217 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  46.83 
 
 		 218 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.8 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.32 
 
 		 218 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  47.29 
 
 		 206 aa  202  5e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  45.66 
 
 		 230 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  50.95 
 
 		 246 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.24 
 
 		 223 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  41.86 
 
 		 224 aa  197  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.31 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.4 
 
 		 223 aa  193  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.15 
 
 		 228 aa  191  8e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.45 
 
 		 197 aa  187  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  47.57 
 
 		 216 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  47.45 
 
 		 199 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.43 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.99 
 
 		 221 aa  180  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.94 
 
 		 197 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  42.31 
 
 		 555 aa  170  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  48.8 
 
 		 221 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  51.53 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  43.75 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  40.98 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  43.75 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  39.82 
 
 		 333 aa  161  9e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.01 
 
 		 323 aa  156  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.55 
 
 		 323 aa  155  3e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  39.07 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  39.17 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  42.42 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  42.42 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  38.01 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.39 
 
 		 206 aa  148  5e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  39.42 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  39.9 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  38.94 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  38.22 
 
 		 222 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  38.22 
 
 		 222 aa  141  7e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  35 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  26.22 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.32 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4998  glutathione S-transferase-like protein  24.86 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0183331  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  24.71 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  24.71 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  24.71 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  24.71 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  24.71 
 
 		 203 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  23.64 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04380  glutathione S-transferase, putative  25 
 
 		 275 aa  52.8  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.276311  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  28.21 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  24.71 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1409  maleylacetoacetate isomerase  27.75 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.513431 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.29 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  24.24 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  24.85 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  24.85 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.24 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.24 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  37.14 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2296  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.23 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.879102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.85 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.258047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>