105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3753 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  100 
 
 
217 aa  447  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  56.22 
 
 
217 aa  258  5.0000000000000005e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  55.66 
 
 
216 aa  241  7.999999999999999e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  49.77 
 
 
224 aa  234  7e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.45 
 
 
220 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.36 
 
 
218 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  47 
 
 
219 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.13 
 
 
225 aa  204  7e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.91 
 
 
227 aa  196  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.37 
 
 
244 aa  194  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.82 
 
 
215 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.84 
 
 
241 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.54 
 
 
213 aa  180  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.46 
 
 
221 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  43.54 
 
 
239 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  43.54 
 
 
218 aa  173  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.39 
 
 
218 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.9 
 
 
218 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.09 
 
 
228 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  44.29 
 
 
213 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  41.78 
 
 
242 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  43.41 
 
 
218 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  44.55 
 
 
205 aa  165  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.93 
 
 
218 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.16 
 
 
223 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.4 
 
 
223 aa  156  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  45.05 
 
 
216 aa  156  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  40.59 
 
 
206 aa  154  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  38.97 
 
 
333 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.35 
 
 
197 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  40.38 
 
 
230 aa  151  7e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.73 
 
 
238 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.93 
 
 
223 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 
221 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  43.3 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.8 
 
 
197 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.61 
 
 
197 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.87 
 
 
323 aa  142  3e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  40.1 
 
 
199 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  37.14 
 
 
219 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  40.47 
 
 
223 aa  141  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  38.5 
 
 
246 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  40 
 
 
223 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  36.11 
 
 
219 aa  138  6e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  35.16 
 
 
219 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  34.68 
 
 
222 aa  135  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.92 
 
 
323 aa  133  1.9999999999999998e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  36.49 
 
 
555 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  43.43 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  35.78 
 
 
212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  36.49 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.91 
 
 
219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.86 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  35.47 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  35.78 
 
 
221 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  35.78 
 
 
221 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  30.88 
 
 
219 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  30.32 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  41.88 
 
 
172 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  35.35 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  35.35 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  27.27 
 
 
206 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3323  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
227 aa  48.5  0.00008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0187385  normal  0.129432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  23.65 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  23.65 
 
 
203 aa  47  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  23.65 
 
 
203 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  23.53 
 
 
236 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  27.78 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.63 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  23.65 
 
 
203 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0885  Glutathione S-transferase domain protein  24.62 
 
 
222 aa  45.1  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.61 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  21.11 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  27.61 
 
 
201 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0812  glutathione S-transferase  22.77 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000181934  hitchhiker  0.000010543 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.11 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  21.11 
 
 
203 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  21.11 
 
 
203 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1820  putative glutathione S-transferase  28.57 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  21.11 
 
 
203 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>