116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3658 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
219 aa  437  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.99 
 
 
228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  54.46 
 
 
230 aa  206  3e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  55.96 
 
 
223 aa  205  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  55.96 
 
 
223 aa  204  6e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  55.84 
 
 
206 aa  202  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  53.03 
 
 
205 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  50.7 
 
 
221 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  50.7 
 
 
221 aa  193  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  53.49 
 
 
555 aa  192  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.7 
 
 
221 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.96 
 
 
323 aa  186  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 
244 aa  186  3e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.76 
 
 
215 aa  185  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.92 
 
 
323 aa  183  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  46.12 
 
 
239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.83 
 
 
213 aa  181  6e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  46.6 
 
 
218 aa  181  9.000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 
219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  44.91 
 
 
246 aa  178  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.66 
 
 
227 aa  177  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  51.04 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  51.04 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  42.73 
 
 
242 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  46.85 
 
 
333 aa  173  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  51.58 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  48.22 
 
 
212 aa  172  5e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.06 
 
 
217 aa  169  3e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
218 aa  168  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.73 
 
 
202 aa  168  5e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  53.81 
 
 
221 aa  168  6e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.5 
 
 
223 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  38.86 
 
 
224 aa  165  5e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
225 aa  164  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.71 
 
 
223 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.15 
 
 
241 aa  162  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  43 
 
 
213 aa  160  1e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.02 
 
 
223 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  47.24 
 
 
199 aa  158  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.7 
 
 
197 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.18 
 
 
238 aa  157  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  39.63 
 
 
222 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.29 
 
 
218 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  44.29 
 
 
218 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.75 
 
 
218 aa  155  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.59 
 
 
221 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.33 
 
 
218 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.18 
 
 
197 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  39.81 
 
 
216 aa  151  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  38.89 
 
 
222 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  37.61 
 
 
226 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.15 
 
 
197 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.49 
 
 
220 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  42.79 
 
 
216 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  34.25 
 
 
219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  32.72 
 
 
219 aa  134  8e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  34.25 
 
 
219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  37.91 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  33.33 
 
 
219 aa  125  5e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  38.35 
 
 
206 aa  121  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  44.79 
 
 
172 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6524  maleylacetoacetate isomerase  34.59 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  27 
 
 
209 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6230  putative glutathione S-transferase  28.87 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5254  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.74 
 
 
226 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  39.13 
 
 
236 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  25.62 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  25.62 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
203 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  27.16 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  27.16 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.79 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  25.79 
 
 
203 aa  46.2  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3573  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.242235  normal  0.0117224 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  25.62 
 
 
203 aa  45.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.62 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  25.62 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  25.62 
 
 
203 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.16 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.11 
 
 
238 aa  45.1  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  26.67 
 
 
224 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  30 
 
 
221 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  29.79 
 
 
206 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5417  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.14 
 
 
214 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.556283  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.16 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.25 
 
 
203 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3505  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.92 
 
 
229 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  31.58 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  30.53 
 
 
203 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>