84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS05689 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  74.55 
 
 		 221 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  74.55 
 
 		 221 aa  323  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  60.95 
 
 		 212 aa  251  6e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  51.49 
 
 		 205 aa  191  7e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.01 
 
 		 219 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.72 
 
 		 213 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  51.83 
 
 		 555 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.84 
 
 		 228 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  51 
 
 		 197 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  48.87 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  48.87 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  47.32 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  48 
 
 		 197 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  48.34 
 
 		 230 aa  167  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  47.5 
 
 		 202 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.02 
 
 		 215 aa  165  4e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 		 219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  45.12 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.5 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  47.5 
 
 		 199 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  43.87 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  44.93 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.41 
 
 		 221 aa  159  4e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  40.97 
 
 		 242 aa  158  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  45.1 
 
 		 223 aa  158  7e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  48.11 
 
 		 216 aa  157  9e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.95 
 
 		 225 aa  157  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.48 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.9 
 
 		 244 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.85 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  46.94 
 
 		 194 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.65 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  50.23 
 
 		 221 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  40.47 
 
 		 213 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.19 
 
 		 227 aa  149  5e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.51 
 
 		 218 aa  148  8e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.84 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.65 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.9 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.5 
 
 		 323 aa  144  8.000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.49 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  39.02 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  43.63 
 
 		 218 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  37.93 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.52 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.63 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.5 
 
 		 323 aa  132  3e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  42.58 
 
 		 333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  35.85 
 
 		 226 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  36.41 
 
 		 217 aa  125  7e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  33.17 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  32.87 
 
 		 219 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  40.24 
 
 		 172 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  34.3 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  35.1 
 
 		 222 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  31.42 
 
 		 219 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.41 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  31.02 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32351  predicted protein  28.93 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2347  Glutathione S-transferase domain protein  25.11 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1112  glutathione S-transferase  30.34 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3532  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.33 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  27.5 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1997  maleylacetoacetate isomerase  29.38 
 
 		 215 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  35.29 
 
 		 199 aa  45.8  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2594  glutathione-S-transferase protein  28.43 
 
 		 224 aa  45.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.445023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0809  Glutathione S-transferase domain protein  41.94 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.803645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2608  glutaredoxin 2  28.05 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.24478 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3910  glutathione S-transferase-like  28.22 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2762  glutathione S-transferase-like  27.88 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4552  Glutathione S-transferase domain protein  40.74 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0663368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2182  glutaredoxin, GrxB family  33.33 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.497266  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5011  glutathione S-transferase-like protein  36.07 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.05677  normal  0.954106 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5640  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.86 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  0.00190893 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4463  Glutathione S-transferase domain  25.13 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0595447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3962  putative glutathione S-transferase  44 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4288  Glutathione S-transferase domain  40.38 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.817272 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04799  glutathione S-transferase  25.99 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1262  glutaredoxin 2  24.87 
 
 		 215 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.224556 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2277  glutaredoxin, GrxB family  30 
 
 		 215 aa  42  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0174  maleylacetoacetate isomerase  32.91 
 
 		 217 aa  41.6  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.974523  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>