190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0154 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0154  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
225 aa  460  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2500  glutathione S-transferase domain-containing protein  64.35 
 
 
218 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2730  glutathione S-transferase domain-containing protein  67.42 
 
 
221 aa  292  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1156  glutathione-S-transferase domain-containing protein  57.67 
 
 
216 aa  276  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1742  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.64 
 
 
217 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.152495  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1428  hypothetical protein  49.06 
 
 
224 aa  221  6e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0774888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3219  glutathione S-transferase domain-containing protein  48.61 
 
 
220 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014021 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2661  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.44 
 
 
219 aa  215  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33351  normal  0.0369922 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1043  glutathione S-transferase domain-containing protein  49.05 
 
 
213 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1972  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.65 
 
 
244 aa  204  8e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000513659  normal  0.0621528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3753  putative glutathione S-transferase  44.13 
 
 
217 aa  204  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1678  glutathione S-transferase-like protein  45.37 
 
 
206 aa  202  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0311729 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1938  glutathione S-transferase domain-containing protein  44.69 
 
 
228 aa  201  7e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1780  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.86 
 
 
227 aa  198  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.736993  normal  0.873608 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0507  glutathione S-transferase-like protein  46.57 
 
 
205 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2525  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.36 
 
 
241 aa  192  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0678  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.06 
 
 
215 aa  190  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1524  Glutathione S-transferase domain protein  45.91 
 
 
223 aa  185  5e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.37941  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2333  glutaredoxin  45.45 
 
 
223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.117922  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2938  glutathione S-transferase-like  42.99 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2379  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
218 aa  180  2e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0241136  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2482  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.14 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00197657  hitchhiker  0.000578467 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1980  Glutathione S-transferase domain protein  43.14 
 
 
218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000166041  hitchhiker  0.000000103503 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1534  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.59 
 
 
238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.56665  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2367  glutathione S-transferase domain-containing protein  41.67 
 
 
218 aa  179  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00131044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0842  glutathione S-transferase  41.9 
 
 
218 aa  178  5.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0347  glutathione S-transferase-like protein  43.27 
 
 
246 aa  177  9e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.158155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0878  glutathione S-transferase-like  41.55 
 
 
239 aa  177  9e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1555  glutathione S-transferase domain-containing protein  43.15 
 
 
197 aa  174  8e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.419878 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3218  glutathione S-transferase-like protein  42.64 
 
 
194 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.847694 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2253  hypothetical protein  43.06 
 
 
213 aa  170  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.867065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4576  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.65 
 
 
221 aa  169  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0297027  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3719  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.13 
 
 
197 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.626847  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3658  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.250305  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1583  glutathione S-transferase domain-containing protein  40.1 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2023  glutathione S-transferase family protein  40.61 
 
 
199 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.905677  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2101  glutathione S-transferase-like protein  39.56 
 
 
242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2262  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
223 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0073858  normal  0.576131 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1759  glutathione S-transferase domain-containing protein  39.15 
 
 
223 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.296868  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  40.65 
 
 
555 aa  155  4e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3641  Glutathione S-transferase domain protein  42.06 
 
 
221 aa  154  8e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0541  glutathione S-transferase domain-containing protein  42.44 
 
 
202 aa  153  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3750  Glutathione S-transferase domain protein  40.76 
 
 
221 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4827  Glutathione S-transferase domain  40.76 
 
 
221 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.7966  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1837  glutathione S-transferase domain-containing protein  40 
 
 
223 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.189454  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3105  hypothetical protein  42.36 
 
 
216 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.028356 
 
 
-
 
NC_003296  RS04766  hypothetical protein  39.8 
 
 
229 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05689  hypothetical protein  39.8 
 
 
229 aa  145  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27941  glutathione S-transferase N terminus protein  36.16 
 
 
333 aa  145  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06571  glutathione S-transferase N terminus  34.98 
 
 
219 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.737712  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1382  glutathione S-transferase  38.31 
 
 
212 aa  142  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.253349  normal  0.0983041 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1396  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.77 
 
 
323 aa  142  6e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06861  glutathione S-transferase N terminus  34.95 
 
 
219 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1636  glutathione S-transferase domain-containing protein  36.32 
 
 
323 aa  138  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0630  glutathione S-transferase  34.47 
 
 
219 aa  137  1e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.731897  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0069  glutathione S-transferase N terminus  35.89 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06911  glutathione S-transferase N terminus  33.94 
 
 
222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06961  glutathione S-transferase N terminus  31.55 
 
 
219 aa  124  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2288  glutathione-S-transferase domain-containing protein  42.94 
 
 
172 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07381  glutathione S-transferase N terminus  31.67 
 
 
226 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.360393 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3613  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.2 
 
 
206 aa  107  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.708574  hitchhiker  0.00347188 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0128  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.54 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.037659  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0138  Glutathione S-transferase domain  29.94 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  0.0861112 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  29.34 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  29.34 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3704  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.885565  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.34 
 
 
203 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  28.74 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  28.74 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2967  glutathione S-transferase-like  28.83 
 
 
203 aa  65.1  0.0000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.191887  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  28.74 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  28.74 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  28.74 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0716  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.83 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.258047 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3932  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.83 
 
 
203 aa  64.7  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.336565 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1002  glutathione S-transferase-like protein  29.01 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.110038  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0755  Glutathione S-transferase domain protein  28.22 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0792  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
203 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.654502  normal  0.227233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0824  glutathione S-transferase-like  28.22 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.317861  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1203  Glutathione S-transferase domain protein  28.22 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3693  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.22 
 
 
203 aa  62.4  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.986206 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0933  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.44 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0263  glutathione S-transferase-like protein  28.05 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000123388  hitchhiker  0.00483772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5500  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.99 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.212095 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0852  putative transcription modulator protein  28.05 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1405  Glutathione S-transferase domain protein  27.33 
 
 
198 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>