280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001434 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001434  glutaredoxin  100 
 
 		 204 aa  413  9.999999999999999e-116  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000262523  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06292  hypothetical protein  91.18 
 
 		 204 aa  388  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0228  glutaredoxin family protein  79.1 
 
 		 212 aa  335  3.9999999999999995e-91  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1529  putative glutaredoxin  81.67 
 
 		 187 aa  318  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.164431  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0884  glutaredoxin  77.53 
 
 		 185 aa  302  2.0000000000000002e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.836695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4080  glutaredoxin family protein  44.16 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0117  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  44.16 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0136  hybrid peroxiredoxin hyPrx5  44.16 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1696  glutaredoxin-3 (grx3)  46.05 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.885496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2214  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  44 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4776  glutaredoxin family protein  37.66 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0077  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4139  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.451689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0071  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 82 aa  63.2  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0758  glutaredoxin family protein  37.36 
 
 		 112 aa  62.8  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3901  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.174559 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4027  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 83 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3920  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 83 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4088  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 83 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3982  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 83 aa  62  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.592495  normal  0.830419 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4817  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378605  hitchhiker  0.000174257 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1790  glutaredoxin GrxC  43.04 
 
 		 86 aa  62  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.711086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03279  putative peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  42.47 
 
 		 246 aa  61.6  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0276999  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2713  hybrid peroxiredoxin (thioredoxin reductase)  40.79 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0126  glutaredoxin-family domain protein  36.36 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.803703  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00036  glutaredoxin  40.79 
 
 		 242 aa  61.6  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002319  peroxiredoxin family protein/glutaredoxin  40.79 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0139  glutaredoxin-like region  38.16 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.406414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2013  glutaredoxin GrxC  42.35 
 
 		 88 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.319354  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  40.54 
 
 		 88 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1856  glutaredoxin-family domain protein  31.17 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0181295  normal  0.435578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1255  glutaredoxin-like region  34.94 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0537  glutaredoxin-family domain protein  34.62 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000148652  unclonable  0.0000000000301239 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0367  AhpC/TSA family/glutaredoxin domain protein  34.62 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000740319  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4452  glutaredoxin-like region  41.56 
 
 		 243 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0125  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03468  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0095  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4038  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03419  hypothetical protein  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4983  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0098  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3947  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.824691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3822  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4114  glutaredoxin 3  38.27 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67740  glutaredoxin  38.82 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000831594  normal  0.879837 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04690  Dithiol-glutaredoxin protein  41.18 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.981866  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0488  glutaredoxin-family domain protein  35.53 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.191714  normal  0.360445 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0558  glutaredoxin 3  38.03 
 
 		 88 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0977481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1062  glutaredoxin 3  33.33 
 
 		 81 aa  57.8  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5863  glutaredoxin  38.82 
 
 		 84 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0474  glutaredoxin-family domain protein  35.53 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4889  thioredoxin reductase  41.56 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.0936024 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0035  peroxiredoxin  36.99 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0854  glutaredoxin  32.93 
 
 		 81 aa  57  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  40.28 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5105  glutaredoxin 3  41.38 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5054  glutaredoxin 3  40.23 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0983125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2175  Redoxin domain protein  32.91 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0411  glutaredoxin 3  42.17 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.845748 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4927  glutaredoxin 3  40.23 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.356634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0311  glutaredoxin 3  33.72 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.257705  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4829  glutaredoxin 3  37.35 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.783956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4883  glutaredoxin  38.82 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2632  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1496  glutaredoxin 3  38.03 
 
 		 85 aa  54.3  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1547  glutaredoxin, GrxC  36.92 
 
 		 96 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0040  glutaredoxin 3  45.83 
 
 		 86 aa  53.9  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.802614 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2441  glutaredoxin GrxC  41.67 
 
 		 85 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3541  glutaredoxin 3  35.65 
 
 		 110 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00379467 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02541  glutaredoxin  36.92 
 
 		 96 aa  54.3  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1796  glutaredoxin family protein  37.04 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.193557  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1689  glutaredoxin family protein  38.16 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0335  glutaredoxin GrxC  40 
 
 		 84 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157321  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0888  glutaredoxin GrxC  39.08 
 
 		 86 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120958  normal  0.333017 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4244  glutaredoxin 3  38.82 
 
 		 86 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.119016 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0464  glutaredoxin  36.47 
 
 		 85 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5325  glutaredoxin  38.82 
 
 		 83 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0784  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  32.93 
 
 		 459 aa  53.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.241048  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2143  glutaredoxin GrxC  37.97 
 
 		 103 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2323  glutaredoxin GrxC  33.73 
 
 		 87 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2186  glutaredoxin GrxC  39.76 
 
 		 85 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1703  glutaredoxin 3  36.47 
 
 		 85 aa  53.1  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2826  glutaredoxin 3  43.21 
 
 		 85 aa  52.8  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3503  glutaredoxin 3  43.21 
 
 		 85 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.337256  normal  0.983249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4355  peroxiredoxin/glutaredoxin family protein  36.84 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2855  glutaredoxin 3  37.5 
 
 		 85 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.995757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1194  glutaredoxin  37.5 
 
 		 85 aa  52.8  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3475  glutaredoxin 3  39.51 
 
 		 85 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2100  glutaredoxin 3  31.87 
 
 		 104 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1311  glutaredoxin GrxC  40.74 
 
 		 89 aa  52  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.755155  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2144  glutaredoxin 3  31.87 
 
 		 104 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  36.14 
 
 		 92 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27371  glutaredoxin  33.73 
 
 		 87 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0368  glutaredoxin 3  36.78 
 
 		 85 aa  52.4  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2363  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 94 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1835  glutaredoxin GrxC  30.12 
 
 		 86 aa  52  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1996  glutaredoxin 3  36.67 
 
 		 94 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.629253  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2777  glutaredoxin 3  32.26 
 
 		 102 aa  52  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2123  glutaredoxin  35.48 
 
 		 265 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.402943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>