20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2587 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2587  glutaredoxin  100 
 
 		 128 aa  262  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0982  glutaredoxin  38.57 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1082  glutaredoxin  27.12 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.976199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3551  glutaredoxin  30.99 
 
 		 106 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.292963  normal  0.115871 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  33.8 
 
 		 384 aa  47.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2689  YruB family glutaredoxin-like protein  34.67 
 
 		 80 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2959  glutaredoxin-like protein, YruB  27.4 
 
 		 168 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1584  glutaredoxin  35.21 
 
 		 147 aa  43.9  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0205634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1784  glutaredoxin and related proteins  38.18 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3678  hypothetical protein  26.32 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1264  glutaredoxin NrdH  30.43 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0898475  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1508  glutaredoxin  27.78 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000114631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4201  glutaredoxin family protein  29.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3897  glutaredoxin family protein  29.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  27.78 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  29.33 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  29.33 
 
 		 78 aa  40  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  29.33 
 
 		 78 aa  40  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  29.33 
 
 		 78 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  29.33 
 
 		 78 aa  40  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>