49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0707 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0707  glutaredoxin  100 
 
 
81 aa  166  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.161206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1038  glutaredoxin-like protein  54.05 
 
 
83 aa  85.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1708  glutaredoxin  55.41 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.252246  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2810  glutaredoxin-like protein  51.35 
 
 
84 aa  83.6  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.201567 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2124  glutaredoxin-like protein  58.21 
 
 
83 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0010  glutaredoxin  49.3 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0851893 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1777  YruB family glutaredoxin-like protein  38.16 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.110535  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1719  YruB family glutaredoxin-like protein  36.84 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0321  glutaredoxin-like protein  55.81 
 
 
53 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.87535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1427  YruB family glutaredoxin-like protein  30.38 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00494984  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0854  YruB family glutaredoxin-like protein  32.89 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00289984  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3219  YruB family glutaredoxin-like protein  45.45 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.890073 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0034  glutaredoxin-like protein, YruB-family  30.14 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4639  glutaredoxin  38.46 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0406  glutaredoxin  35.06 
 
 
383 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0240048  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2119  glutaredoxin-like protein NrdH  34.18 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000183339 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0235  YruB family glutaredoxin-like protein  32.43 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000377018  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1531  peptide methionine sulfoxide reductase  31.51 
 
 
260 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0149191  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0552  YruB family glutaredoxin-like protein  28.95 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1344  YruB family glutaredoxin-like protein  30.14 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.458905  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0738  glutaredoxin GrxC  38.16 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1149  glutaredoxin family protein  36.36 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1323  YruB family glutaredoxin-like protein  28.77 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0672581  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2433  glutaredoxin  33.93 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2747  YruB family glutaredoxin-like protein  33.93 
 
 
75 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2340  glutaredoxin  29.17 
 
 
78 aa  43.9  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.340679  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1555  glutaredoxin  48.48 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000316577  normal  0.150299 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0084  glutaredoxin  35.06 
 
 
384 aa  43.5  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.833578  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1609  glutaredoxin-like protein, YruB  28.17 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.645814  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2583  glutaredoxin  34.33 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1737  glutaredoxin GrxC  48.48 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0513723  normal  0.163963 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5356  glutaredoxin 3  53.66 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.957848 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2899  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2449  hypothetical protein  38.18 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2075  glutaredoxin  38.18 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4052  glutaredoxin  45 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0556  glutaredoxin  31.94 
 
 
77 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0146434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2334  YruB family glutaredoxin-like protein  27.63 
 
 
194 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573032  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2358  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  31.58 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.543231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4091  glutaredoxin family protein  30.56 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2586  glutaredoxin 3  36.36 
 
 
88 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.630404 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0792  glutaredoxin-like protein, YruB-family  33.33 
 
 
81 aa  40.8  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3745  glutaredoxin family protein  30.56 
 
 
78 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10470  ribonucleoside-diphosphate reductase class Ib glutaredoxin subunit  38.18 
 
 
81 aa  40.4  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00700177  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4003  glutaredoxin family protein  30.56 
 
 
78 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4108  glutaredoxin family protein  30.56 
 
 
78 aa  40  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0808  glutaredoxin 3  51.72 
 
 
87 aa  40.4  0.01  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.166784  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3729  glutaredoxin family protein  30.56 
 
 
78 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4037  glutaredoxin family protein  30.56 
 
 
78 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.141219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>