More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2300 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2300  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 493 aa  992    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.726424  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0104  periplasmic serine protease DO  39.82 
 
 		 474 aa  288  1e-76  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  35.71 
 
 		 472 aa  257  4e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  35.83 
 
 		 506 aa  256  5e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  36.72 
 
 		 471 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  35.05 
 
 		 504 aa  251  2e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  37.33 
 
 		 456 aa  250  5e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  35.14 
 
 		 502 aa  247  4e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  35.06 
 
 		 476 aa  246  8e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  37.16 
 
 		 446 aa  245  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0744  2-alkenal reductase  38.2 
 
 		 450 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00191674  normal  0.314377 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  38.44 
 
 		 449 aa  244  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  34.46 
 
 		 498 aa  243  5e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  36.93 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  36.64 
 
 		 502 aa  243  7e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  36.92 
 
 		 480 aa  242  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  36.06 
 
 		 463 aa  239  8e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  36.06 
 
 		 457 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  36.06 
 
 		 457 aa  239  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  37.05 
 
 		 453 aa  239  9e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.67 
 
 		 476 aa  239  9e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.19 
 
 		 476 aa  239  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  36.74 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  36.25 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  37.92 
 
 		 455 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  36.25 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  36.25 
 
 		 450 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0988  protease Do  35.86 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0294533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  37.59 
 
 		 492 aa  238  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  38.52 
 
 		 477 aa  237  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  34.94 
 
 		 483 aa  237  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  36.63 
 
 		 450 aa  237  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0923  protease Do  35.86 
 
 		 503 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.123789 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  34.71 
 
 		 483 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  36.17 
 
 		 451 aa  236  6e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  36.87 
 
 		 496 aa  236  6e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  36.3 
 
 		 450 aa  236  9e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  38.52 
 
 		 477 aa  236  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  36.12 
 
 		 478 aa  236  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1058  periplasmic protease signal peptide protein  36.22 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.200885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  35.67 
 
 		 489 aa  235  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0943  protease Do  35.93 
 
 		 491 aa  234  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.250261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  38.32 
 
 		 479 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  40.1 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  38.59 
 
 		 455 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  36.99 
 
 		 482 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  38.32 
 
 		 474 aa  234  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2667  exported serine protease  38 
 
 		 455 aa  233  5e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0124774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  35.92 
 
 		 449 aa  233  6e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  36.85 
 
 		 503 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  38.07 
 
 		 474 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.11 
 
 		 479 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0296  protease Do  35.04 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0105337  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  36.21 
 
 		 505 aa  230  4e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  37.16 
 
 		 498 aa  230  5e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  35.66 
 
 		 458 aa  230  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  35.9 
 
 		 498 aa  229  7e-59  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2903  protease Do  40 
 
 		 505 aa  229  8e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.580104  normal  0.459508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  39.01 
 
 		 485 aa  229  8e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3669  serine endoprotease  35.04 
 
 		 455 aa  229  9e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0364754  normal  0.327931 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  37.09 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  37.09 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  34.95 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  34.95 
 
 		 450 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  37.09 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  34.47 
 
 		 466 aa  229  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  35.89 
 
 		 485 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  37.09 
 
 		 474 aa  228  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  34.95 
 
 		 450 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  34.89 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  37.09 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  39.26 
 
 		 481 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  37.09 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4242  peptidase S1C, Do  39.5 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0837  protease Do  38.25 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  35.81 
 
 		 476 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  39.12 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3598  protease Do  36.54 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.133395  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  32.9 
 
 		 483 aa  228  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  37.09 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  33.99 
 
 		 500 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  37.09 
 
 		 474 aa  228  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  39.02 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0510  peptidase S1C, Do  35.71 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.727418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  39.02 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  39.02 
 
 		 498 aa  228  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  37.06 
 
 		 500 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  36.69 
 
 		 497 aa  227  4e-58  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  37.8 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  37.8 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  37.8 
 
 		 502 aa  227  4e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  34.58 
 
 		 478 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  35.91 
 
 		 475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  34.58 
 
 		 478 aa  227  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  35.91 
 
 		 475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1081  hypothetical protein  38.23 
 
 		 507 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  35.91 
 
 		 475 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  37.8 
 
 		 461 aa  226  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  37.8 
 
 		 485 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  37.8 
 
 		 502 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>