39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1588 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1588  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  579  1e-164  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  32.64 
 
 
301 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  30.23 
 
 
325 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2089  thioredoxin domain-containing protein  30.42 
 
 
304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.576452  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0234  Vitamin K epoxide reductase  31.32 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01141  hypothetical protein  29.97 
 
 
316 aa  109  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.450714 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01721  hypothetical protein  30.48 
 
 
313 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156137  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0639  thioredoxin domain-containing protein  31.37 
 
 
327 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  0.153578 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1469  thioredoxin domain-containing protein  30.48 
 
 
313 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0446  vitamin K epoxide reductase  28.85 
 
 
327 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38289  predicted protein  30.38 
 
 
303 aa  103  4e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0660789  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01161  hypothetical protein  27.4 
 
 
311 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.28971  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02171  hypothetical protein  30.27 
 
 
313 aa  99.4  7e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0105  thioredoxin domain-containing protein  28.37 
 
 
311 aa  98.6  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3166  Vitamin K epoxide reductase  27.4 
 
 
325 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2930  Vitamin K epoxide reductase  27.4 
 
 
325 aa  96.3  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2336  thioredoxin domain-containing protein  28.9 
 
 
309 aa  95.9  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.560711  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0354  thioredoxin domain-containing protein  29.57 
 
 
309 aa  92.4  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01131  hypothetical protein  25.61 
 
 
311 aa  91.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01171  hypothetical protein  27.4 
 
 
311 aa  86.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10031  hypothetical protein  44.94 
 
 
129 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10041  hypothetical protein  46.07 
 
 
129 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0354687  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11661  hypothetical protein  42.42 
 
 
136 aa  78.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.041891 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48122  predicted protein  24.24 
 
 
366 aa  63.5  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03861  hypothetical protein  40.96 
 
 
163 aa  62.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1830  hypothetical protein  40.26 
 
 
155 aa  61.6  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.788701  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  32.59 
 
 
553 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_7784  predicted protein  47.76 
 
 
79 aa  61.6  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.980517  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3618  Vitamin K epoxide reductase  33.59 
 
 
339 aa  59.3  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00203549  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1458  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  58.9  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.291416  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  28.87 
 
 
151 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1734  Vitamin K epoxide reductase  36.52 
 
 
145 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2257  vitamin K epoxide reductase  29.77 
 
 
438 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435808  normal  0.0387606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0493  vitamin K epoxide reductase  32.58 
 
 
342 aa  49.3  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6023  Vitamin K epoxide reductase  35.14 
 
 
139 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.375701  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30533  predicted protein  43.48 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.183112 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  29.23 
 
 
164 aa  46.6  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0505  hypothetical protein  38.24 
 
 
134 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.235262  normal  0.123807 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30774  predicted protein  31.96 
 
 
227 aa  42.7  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>