40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2089 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2089  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 
304 aa  619  1e-176  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.576452  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0468  Vitamin K epoxide reductase  47.96 
 
 
325 aa  294  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3166  Vitamin K epoxide reductase  45.77 
 
 
325 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2930  Vitamin K epoxide reductase  45.77 
 
 
325 aa  288  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0104  vitamin K epoxide reductase  47.06 
 
 
301 aa  288  9e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0234  Vitamin K epoxide reductase  45.42 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1469  thioredoxin domain-containing protein  44.04 
 
 
313 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0639  thioredoxin domain-containing protein  45.37 
 
 
327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.631797  normal  0.153578 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01721  hypothetical protein  43.71 
 
 
313 aa  266  2.9999999999999995e-70  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.156137  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0446  vitamin K epoxide reductase  39.32 
 
 
327 aa  257  2e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01141  hypothetical protein  43 
 
 
316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.450714 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0354  thioredoxin domain-containing protein  45.93 
 
 
309 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01161  hypothetical protein  43.56 
 
 
311 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.28971  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2336  thioredoxin domain-containing protein  43 
 
 
309 aa  241  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.560711  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0105  thioredoxin domain-containing protein  41.91 
 
 
311 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02171  hypothetical protein  44.37 
 
 
313 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01131  hypothetical protein  41.25 
 
 
311 aa  228  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01171  hypothetical protein  43.28 
 
 
311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38289  predicted protein  36 
 
 
303 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0660789  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1588  hypothetical protein  30.42 
 
 
288 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.302546  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48122  predicted protein  30.6 
 
 
366 aa  113  4.0000000000000004e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11661  hypothetical protein  49.48 
 
 
136 aa  109  7.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.041891 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10031  hypothetical protein  47.17 
 
 
129 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10041  hypothetical protein  48.48 
 
 
129 aa  106  4e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0354687  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_7784  predicted protein  50.68 
 
 
79 aa  88.6  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.980517  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1830  hypothetical protein  37.07 
 
 
155 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.788701  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30533  predicted protein  33.33 
 
 
216 aa  64.3  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.183112 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1458  hypothetical protein  31.54 
 
 
137 aa  63.2  0.000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.291416  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03861  hypothetical protein  37 
 
 
163 aa  62.4  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.241979 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.66 
 
 
553 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  24.82 
 
 
142 aa  50.8  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1688  Vitamin K epoxide reductase  30.86 
 
 
547 aa  50.4  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.559526  normal  0.233843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  24.67 
 
 
390 aa  49.3  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2066  vitamin K epoxide reductase  26.06 
 
 
164 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.293571  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0505  hypothetical protein  35.78 
 
 
134 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.235262  normal  0.123807 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3618  Vitamin K epoxide reductase  30.99 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00203549  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0611  vitamin K epoxide reductase  26.49 
 
 
166 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5771  Vitamin K epoxide reductase  30.37 
 
 
151 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1734  Vitamin K epoxide reductase  29.08 
 
 
145 aa  43.9  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00248  PDI related protein A (Eurofung)  27.78 
 
 
455 aa  42.4  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>