156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0519 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  100 
 
 		 390 aa  805    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  38.03 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  32.39 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  33.1 
 
 		 411 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  31.69 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  24.14 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  30.38 
 
 		 664 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 339 aa  66.6  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.36 
 
 		 263 aa  65.9  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 248 aa  65.1  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  21.51 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 262 aa  63.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  25.44 
 
 		 270 aa  62  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  24.88 
 
 		 213 aa  61.6  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  23.67 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  30.39 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.74 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  25.15 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  26.35 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  26.35 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  24.55 
 
 		 207 aa  59.3  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 		 265 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  22.95 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  25.75 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 263 aa  58.5  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.74 
 
 		 349 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 		 250 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 230 aa  57  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 173 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 		 179 aa  57  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 		 335 aa  57  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  21.82 
 
 		 288 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  24.28 
 
 		 252 aa  57  0.0000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  24.28 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  22.28 
 
 		 270 aa  56.2  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 182 aa  56.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  22.28 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  22.87 
 
 		 240 aa  55.5  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  23.63 
 
 		 263 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 349 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  24.66 
 
 		 208 aa  55.1  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  24.72 
 
 		 671 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 257 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  26.22 
 
 		 616 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  25.95 
 
 		 238 aa  53.9  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  27.44 
 
 		 627 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  19.65 
 
 		 276 aa  53.5  0.000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0098  protein-disulfide isomerase-like protein  23.33 
 
 		 231 aa  53.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000192012  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  27.74 
 
 		 257 aa  53.5  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  21.74 
 
 		 294 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 247 aa  53.1  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  26.35 
 
 		 212 aa  53.1  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 221 aa  52.8  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.98 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  24.49 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  24.49 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  27.22 
 
 		 222 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.98 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  24.72 
 
 		 230 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25 
 
 		 242 aa  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0226  Vitamin K epoxide reductase  35.11 
 
 		 142 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 182 aa  51.6  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  26.58 
 
 		 876 aa  51.2  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 227 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 236 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 197 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 263 aa  51.2  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  24 
 
 		 274 aa  50.8  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01131  hypothetical protein  30.3 
 
 		 311 aa  50.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  24.16 
 
 		 671 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  24.16 
 
 		 671 aa  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 228 aa  50.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  27.44 
 
 		 644 aa  49.7  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 214 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 		 210 aa  49.7  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2089  thioredoxin domain-containing protein  24.67 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.576452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 210 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  27.4 
 
 		 629 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  23.6 
 
 		 265 aa  49.3  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  24.73 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 		 244 aa  48.9  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1440  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0871761  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  24.18 
 
 		 600 aa  48.5  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  24.84 
 
 		 182 aa  48.5  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  21.16 
 
 		 272 aa  48.5  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  26.04 
 
 		 217 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  25.34 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  26.19 
 
 		 211 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 262 aa  47.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 265 aa  47.8  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  20.62 
 
 		 276 aa  47.4  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  20.62 
 
 		 273 aa  47  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 259 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>