292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2412 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  79.19 
 
 		 179 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  50.6 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  49.39 
 
 		 173 aa  148  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  46.58 
 
 		 624 aa  147  8e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  50.33 
 
 		 876 aa  144  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  43.6 
 
 		 652 aa  130  9e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  48.63 
 
 		 629 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  46.75 
 
 		 616 aa  128  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  41.04 
 
 		 652 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 		 182 aa  121  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  39.02 
 
 		 349 aa  121  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  43.59 
 
 		 185 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  44.31 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  39.02 
 
 		 348 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  39.02 
 
 		 349 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  45.1 
 
 		 613 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  45.1 
 
 		 613 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  45.1 
 
 		 613 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  44.81 
 
 		 617 aa  117  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  39.63 
 
 		 354 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  35.44 
 
 		 339 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  45.1 
 
 		 617 aa  114  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  42.21 
 
 		 553 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  46 
 
 		 600 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  40.88 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  38.18 
 
 		 267 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.52 
 
 		 270 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  36.57 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  39.88 
 
 		 173 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 		 179 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 671 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  37.95 
 
 		 671 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 335 aa  107  9.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  35.12 
 
 		 288 aa  107  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 262 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  37.35 
 
 		 671 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  34.84 
 
 		 263 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 265 aa  103  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  40.13 
 
 		 172 aa  101  5e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  39.62 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  37.97 
 
 		 224 aa  99  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 263 aa  97.1  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  37.91 
 
 		 630 aa  95.5  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.04 
 
 		 664 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 249 aa  95.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 296 aa  94.4  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 307 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 235 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 273 aa  91.3  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  39.86 
 
 		 219 aa  91.3  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 276 aa  90.9  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  38.61 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 214 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 269 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 		 221 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 262 aa  88.2  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 313 aa  88.2  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  38.79 
 
 		 227 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 219 aa  87.4  9e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  37.41 
 
 		 311 aa  87.4  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  37.59 
 
 		 248 aa  87  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  37.41 
 
 		 311 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  37.68 
 
 		 311 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  35.22 
 
 		 335 aa  86.7  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 219 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 229 aa  85.1  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  30.92 
 
 		 179 aa  84.7  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 232 aa  84.7  7e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 253 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 		 241 aa  84.3  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  33.91 
 
 		 627 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  36.3 
 
 		 398 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  34.97 
 
 		 234 aa  82  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  33.33 
 
 		 644 aa  82  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 281 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 		 255 aa  80.9  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 227 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  37.41 
 
 		 228 aa  81.3  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.52 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  37.41 
 
 		 155 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  29.73 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  36.05 
 
 		 411 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 306 aa  77.8  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 281 aa  77.8  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  34.75 
 
 		 390 aa  77.8  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  32.74 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  34.75 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>