177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0115 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
274 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  89.71 
 
 
294 aa  508  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  88.6 
 
 
294 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  88.97 
 
 
270 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  63.64 
 
 
263 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  58.21 
 
 
272 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  55.56 
 
 
244 aa  233  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 
238 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  35.09 
 
 
207 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  35.09 
 
 
207 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  35.09 
 
 
207 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  35.09 
 
 
207 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  34.5 
 
 
207 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.05 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  35.53 
 
 
238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  32.91 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
260 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  31.46 
 
 
265 aa  103  2e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
255 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  27.82 
 
 
259 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  30.89 
 
 
269 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  26.61 
 
 
254 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  27.31 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  27.31 
 
 
265 aa  99.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  28.05 
 
 
259 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0760  putative suppressor for copper-sensitivity C precursor  29.41 
 
 
216 aa  97.4  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 
259 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  29.02 
 
 
247 aa  95.9  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
247 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 
263 aa  91.3  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  25.3 
 
 
260 aa  90.5  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  26.48 
 
 
255 aa  90.1  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  26.13 
 
 
252 aa  88.2  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 
255 aa  88.2  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  26.94 
 
 
247 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  26.58 
 
 
252 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  23.72 
 
 
266 aa  87.4  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 
255 aa  86.7  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  24.54 
 
 
243 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  24.54 
 
 
243 aa  85.9  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  26.24 
 
 
257 aa  85.5  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 
255 aa  85.5  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  23.83 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  26.18 
 
 
254 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.88 
 
 
253 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
255 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  22.01 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  27.35 
 
 
275 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  24.09 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  28.85 
 
 
664 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  21.62 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  25 
 
 
274 aa  76.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  23.14 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  23.63 
 
 
253 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  27.19 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  26.48 
 
 
261 aa  72.4  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
248 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  24.53 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 
535 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  25.7 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  21.92 
 
 
262 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 
671 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
217 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  24.87 
 
 
671 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  22.63 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
273 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  26.51 
 
 
671 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 
265 aa  65.1  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  30.32 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 
209 aa  63.5  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  25.95 
 
 
211 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  25.14 
 
 
198 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 
211 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  22.71 
 
 
288 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  23.32 
 
 
263 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  26 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 
211 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  23.11 
 
 
257 aa  60.5  0.00000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  25.42 
 
 
210 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  24.83 
 
 
211 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6235  putative thiol:disulfide interchange protein  28.86 
 
 
256 aa  57  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  26.01 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  20.9 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
211 aa  56.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  26.01 
 
 
276 aa  56.2  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 
235 aa  55.8  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  24.12 
 
 
209 aa  55.8  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  24.1 
 
 
276 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  24.57 
 
 
349 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>