More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1148 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
265 aa  546  1e-154  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  50.37 
 
 
263 aa  275  4e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  48.81 
 
 
265 aa  258  6e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  46.69 
 
 
247 aa  243  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  56.52 
 
 
240 aa  237  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  44.68 
 
 
268 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  41.88 
 
 
269 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  45.66 
 
 
220 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  44.22 
 
 
232 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  46.33 
 
 
349 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  46.89 
 
 
348 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  46.89 
 
 
349 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  43.93 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  37.08 
 
 
262 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  38.38 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  42.2 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  41.42 
 
 
241 aa  132  5e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  43.18 
 
 
354 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  40.27 
 
 
253 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
671 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  40 
 
 
671 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  36.02 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  36.47 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  36.52 
 
 
335 aa  119  3.9999999999999996e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 
242 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  40 
 
 
671 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.04 
 
 
339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.8 
 
 
293 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 
664 aa  115  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 
251 aa  113  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  44.17 
 
 
553 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  39.35 
 
 
231 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  35.29 
 
 
284 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 
251 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  36.26 
 
 
254 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 
228 aa  107  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 
246 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 
229 aa  106  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
179 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 
217 aa  104  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
255 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
230 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  37.5 
 
 
616 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.07 
 
 
216 aa  101  1e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  33.55 
 
 
624 aa  100  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 
196 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
276 aa  99.4  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
227 aa  98.6  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.34 
 
 
217 aa  97.4  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.1 
 
 
286 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  31.87 
 
 
279 aa  96.7  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  36.77 
 
 
876 aa  95.9  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  37.27 
 
 
182 aa  95.9  6e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  32.92 
 
 
182 aa  95.5  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 
335 aa  95.9  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  34 
 
 
307 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 
241 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  36.99 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  34.67 
 
 
398 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.34 
 
 
244 aa  94.4  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  30.94 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 
220 aa  94.4  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  34.42 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
288 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 
227 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 
299 aa  93.2  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 
243 aa  93.2  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  32.75 
 
 
217 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  32.75 
 
 
217 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 
236 aa  92.4  6e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  32.37 
 
 
226 aa  92.4  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
182 aa  92  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 
219 aa  92  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
269 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 
281 aa  91.3  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  27.64 
 
 
220 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 
210 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  35.26 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  29.47 
 
 
241 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 
173 aa  89.7  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  32.16 
 
 
217 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  30.2 
 
 
233 aa  89.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
229 aa  89.4  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  34.87 
 
 
629 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  32.74 
 
 
228 aa  89.4  6e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  37.16 
 
 
243 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  31.86 
 
 
263 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 
311 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 
311 aa  89  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.52 
 
 
281 aa  88.6  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  35 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  28.02 
 
 
224 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  32.02 
 
 
411 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 
219 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  35.84 
 
 
219 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>