249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4235 on replicon NC_008539
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  78.57 
 
 		 229 aa  352  2e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  62.27 
 
 		 227 aa  276  2e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  48.34 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 		 221 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  58.14 
 
 		 174 aa  191  7e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  58.08 
 
 		 237 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  47.49 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  47.49 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  47.91 
 
 		 234 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  47.49 
 
 		 219 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  46.89 
 
 		 219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  48.33 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  44.64 
 
 		 227 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  44.64 
 
 		 313 aa  176  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  45.54 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  50.94 
 
 		 235 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  48.22 
 
 		 214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  48.48 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  46.59 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  50 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  46.55 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  42.5 
 
 		 219 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 212 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 		 243 aa  98.6  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  33.83 
 
 		 624 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  36.5 
 
 		 335 aa  95.1  8e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  36.69 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 219 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 		 247 aa  92  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 336 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  34.09 
 
 		 253 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 		 339 aa  88.6  8e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  38.41 
 
 		 671 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  39.46 
 
 		 196 aa  87.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  38.41 
 
 		 671 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  35.75 
 
 		 616 aa  87  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  33.11 
 
 		 204 aa  87.4  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  33.76 
 
 		 553 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  33.57 
 
 		 265 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  35.21 
 
 		 221 aa  85.5  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 179 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  37.41 
 
 		 671 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.37 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  32.39 
 
 		 876 aa  82.8  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 173 aa  82.4  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 218 aa  82  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 349 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.41 
 
 		 664 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 354 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  33.01 
 
 		 613 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  33.01 
 
 		 613 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  33.01 
 
 		 613 aa  79.7  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  35.86 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 307 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  29.08 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.62 
 
 		 263 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  24.62 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  32.62 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  33.56 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  33.1 
 
 		 335 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  33.79 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 273 aa  71.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  35.77 
 
 		 630 aa  69.3  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  32.47 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  31.51 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 248 aa  68.9  0.00000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  29.45 
 
 		 268 aa  68.6  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  30.43 
 
 		 617 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  30.35 
 
 		 600 aa  67  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  31.51 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  32.86 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  30.82 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 293 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  35.48 
 
 		 652 aa  65.9  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  25.88 
 
 		 390 aa  65.5  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  34.19 
 
 		 652 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  27.66 
 
 		 179 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  32.62 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.25 
 
 		 229 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  25.63 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>