157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0579 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  374  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  38.69 
 
 		 613 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  38.69 
 
 		 613 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  38.69 
 
 		 613 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  34.62 
 
 		 624 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  38.1 
 
 		 617 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0238  Na+/H+ antiporter NhaA  39.29 
 
 		 617 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  34 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 671 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 671 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  34.39 
 
 		 876 aa  96.3  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 335 aa  95.9  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.39 
 
 		 173 aa  95.5  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  32.69 
 
 		 616 aa  92  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 182 aa  91.7  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.97 
 
 		 671 aa  91.3  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  34.62 
 
 		 629 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  34.19 
 
 		 652 aa  90.5  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 196 aa  89.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 664 aa  89  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  33.99 
 
 		 262 aa  87  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  33.55 
 
 		 652 aa  84.7  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 182 aa  84.3  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0111  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  30.25 
 
 		 600 aa  77.8  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 182 aa  77.4  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 265 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 172 aa  75.1  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  32.3 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  31.93 
 
 		 630 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 348 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.15 
 
 		 339 aa  68.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.67 
 
 		 349 aa  68.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.67 
 
 		 224 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 		 173 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  31.08 
 
 		 553 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3230  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 155 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.323815  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.26 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 		 311 aa  65.9  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 		 268 aa  65.5  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3226  Na+/H+ antiporter NhaA  29.52 
 
 		 627 aa  65.5  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25.84 
 
 		 263 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  30.22 
 
 		 311 aa  64.3  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3118  Na+/H+ antiporter NhaA  28.66 
 
 		 644 aa  64.3  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.875307  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.47 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  28.47 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  28.17 
 
 		 235 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  29.37 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  28.48 
 
 		 624 aa  62  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  31.03 
 
 		 398 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 234 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  25.31 
 
 		 240 aa  60.8  0.000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  29.37 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  28.37 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0426  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 		 515 aa  58.2  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 227 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.07 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  28.06 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  24.65 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  27.21 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  24.55 
 
 		 263 aa  54.7  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  29.73 
 
 		 390 aa  54.3  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 219 aa  54.3  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 		 354 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 		 251 aa  53.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 229 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 230 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  27.63 
 
 		 411 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  26.82 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  22.22 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 214 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  28.12 
 
 		 232 aa  52  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  26.04 
 
 		 275 aa  51.6  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  25.83 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3762  hypothetical protein  23.23 
 
 		 258 aa  51.2  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>