235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0746 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
225 aa  459  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  79.03 
 
 
229 aa  317  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  53.85 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  51.87 
 
 
217 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  53.85 
 
 
217 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6941  DSBA oxidoreductase  55.93 
 
 
214 aa  214  8e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0159704 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0716  DsbA oxidoreductase  51.3 
 
 
214 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.47866  normal  0.709389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  49.53 
 
 
214 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  56.35 
 
 
229 aa  204  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  55.03 
 
 
270 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  49.73 
 
 
243 aa  201  6e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  50.55 
 
 
269 aa  195  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 
210 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  44.2 
 
 
227 aa  187  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  47.28 
 
 
256 aa  184  7e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  47.28 
 
 
256 aa  184  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  47.09 
 
 
218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  43.52 
 
 
220 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  46.82 
 
 
233 aa  176  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  47.73 
 
 
217 aa  175  6e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  46.12 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  41.59 
 
 
244 aa  170  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  42.99 
 
 
220 aa  169  2e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  44.09 
 
 
220 aa  168  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1197  twin-arginine translocation pathway signal  48.86 
 
 
222 aa  167  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  37.96 
 
 
216 aa  156  3e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  35.16 
 
 
223 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  35.32 
 
 
233 aa  131  6.999999999999999e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4372  DSBA oxidoreductase  40.25 
 
 
211 aa  128  6e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  40.83 
 
 
217 aa  125  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2197  protein-disulfide isomerase-like protein  36.95 
 
 
257 aa  125  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.67008 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  35.29 
 
 
239 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  39.74 
 
 
228 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  39.74 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 
223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4371  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 
211 aa  115  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.958001 
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  36.36 
 
 
234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  37.18 
 
 
240 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4693  protein-disulfide isomerase-like protein  32.98 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.68615  normal  0.364343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  35.18 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0397  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  32.26 
 
 
227 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  32.14 
 
 
209 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
240 aa  94.7  9e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 
265 aa  94.7  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0956  protein-disulfide isomerase  28.11 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00982251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2198  protein-disulfide isomerase-like protein  33.99 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.668771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
253 aa  87.4  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 
247 aa  87  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0900  hypothetical protein  28.7 
 
 
230 aa  87.4  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000692645  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 
265 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  30.96 
 
 
263 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2269  protein-disulfide isomerase  28.9 
 
 
245 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.15449  normal  0.669339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 
255 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 
268 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
242 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  36.42 
 
 
228 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
232 aa  80.9  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4692  protein-disulfide isomerase-like protein  29.1 
 
 
241 aa  79.7  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.384843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
228 aa  79  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  28.7 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 
269 aa  75.9  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 
246 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 
236 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  29.7 
 
 
652 aa  68.9  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 
220 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
348 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
221 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  31.58 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25.83 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.34 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.44 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 
335 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 
349 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  29.09 
 
 
652 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 
182 aa  65.1  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 
217 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
219 aa  64.7  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  26.63 
 
 
213 aa  63.9  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2268  protein-disulfide isomerase  31.25 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.873653  normal  0.987426 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  28.85 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.49 
 
 
217 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 
236 aa  63.5  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.49 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  27.81 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  27.81 
 
 
218 aa  62.4  0.000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 
293 aa  62.4  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 
220 aa  61.6  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>