More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1822 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 230 aa  461  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  47.27 
 
 		 281 aa  154  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  49.4 
 
 		 279 aa  153  2e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  45.93 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  42.24 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  40.12 
 
 		 269 aa  134  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  35.47 
 
 		 221 aa  133  3e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  40.61 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  42.33 
 
 		 282 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  32.75 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 		 247 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  35.88 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 251 aa  121  7e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 263 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 214 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  35.2 
 
 		 265 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  37.85 
 
 		 339 aa  117  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 335 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  36.75 
 
 		 348 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  36.75 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  36.14 
 
 		 349 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  30 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  30 
 
 		 219 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  30 
 
 		 216 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  29.52 
 
 		 216 aa  104  9e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.52 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.52 
 
 		 216 aa  104  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  39.74 
 
 		 664 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  38 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.54 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  36.7 
 
 		 624 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 		 242 aa  102  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.09 
 
 		 876 aa  102  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36.14 
 
 		 354 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  27.98 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 217 aa  99.8  4e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 		 652 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  39.16 
 
 		 616 aa  97.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 		 293 aa  97.1  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  36.13 
 
 		 248 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  32.93 
 
 		 275 aa  96.3  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  35.15 
 
 		 652 aa  95.9  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 263 aa  95.5  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 227 aa  95.5  6e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 		 307 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  41.5 
 
 		 629 aa  93.2  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 217 aa  92.8  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.33 
 
 		 217 aa  91.7  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  32.96 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 288 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 671 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 671 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 173 aa  89.4  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.54 
 
 		 253 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  34.9 
 
 		 228 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  31.93 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  35.33 
 
 		 244 aa  88.2  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 249 aa  87.8  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  34.9 
 
 		 223 aa  88.2  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 228 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 243 aa  86.7  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  33.13 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 		 223 aa  85.5  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  29.8 
 
 		 284 aa  85.1  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  33.73 
 
 		 210 aa  85.5  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  30.51 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 		 218 aa  85.1  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 276 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32 
 
 		 270 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 257 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.68 
 
 		 671 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0400  protein-disulfide isomerase-like protein  29.82 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  33.55 
 
 		 223 aa  84.7  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  40.14 
 
 		 172 aa  84  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>