More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1348 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 281 aa  564  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  41.34 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  44.29 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  47.73 
 
 		 282 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  46.75 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  38.03 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  43.18 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 		 288 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  37.36 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.8 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.71 
 
 		 349 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 		 348 aa  99.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 		 349 aa  98.2  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  34.5 
 
 		 270 aa  96.3  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.98 
 
 		 219 aa  95.5  8e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 		 293 aa  95.5  8e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 354 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 265 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  31.15 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 240 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 339 aa  89  7e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 335 aa  87  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 221 aa  85.9  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  31.07 
 
 		 236 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  32.56 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  34.13 
 
 		 296 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  32.17 
 
 		 629 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.22 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  32.67 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  32.67 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.11 
 
 		 209 aa  81.6  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 273 aa  81.6  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  31.13 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  32.67 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  30.95 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  31.13 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  32.67 
 
 		 217 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 210 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  31.13 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 211 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  23.9 
 
 		 263 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  35.76 
 
 		 616 aa  80.1  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  30.46 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  31.79 
 
 		 219 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.96 
 
 		 275 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 		 671 aa  78.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 251 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  32.18 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  32.89 
 
 		 624 aa  78.2  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  31.55 
 
 		 652 aa  78.2  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  27.07 
 
 		 270 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.46 
 
 		 671 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 242 aa  75.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  32.51 
 
 		 211 aa  75.9  0.0000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  33.93 
 
 		 600 aa  75.5  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  34.21 
 
 		 173 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 		 262 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  30.99 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  30.99 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 249 aa  74.7  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  30.99 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  27.34 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  27.34 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  30.56 
 
 		 652 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  33.54 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  25.61 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.12 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  29.12 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  22.83 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 210 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  28.65 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 		 260 aa  72.8  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>