More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2428 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 255 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  42.97 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  43.22 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  43.22 
 
 		 243 aa  171  7.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  36.22 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  36.1 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  37.05 
 
 		 255 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  36.1 
 
 		 252 aa  158  7e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  35.06 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  35.74 
 
 		 252 aa  158  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  42.8 
 
 		 253 aa  158  9e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  37.28 
 
 		 259 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  36.49 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  39.46 
 
 		 257 aa  155  8e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  34.8 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  35.81 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  34 
 
 		 274 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  37.09 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  37.09 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 266 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  36.95 
 
 		 268 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  35.08 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  34.53 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  34.68 
 
 		 254 aa  138  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  34.53 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  35.56 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  37.86 
 
 		 250 aa  136  4e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  35.89 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  35.89 
 
 		 261 aa  135  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  42.69 
 
 		 236 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  43.16 
 
 		 205 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  35.54 
 
 		 252 aa  131  7.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  41.61 
 
 		 211 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  36.93 
 
 		 250 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  37.34 
 
 		 209 aa  128  9.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  39.88 
 
 		 217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  30.99 
 
 		 265 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  30.88 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  40.36 
 
 		 222 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  40.48 
 
 		 211 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.72 
 
 		 204 aa  122  7e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.72 
 
 		 204 aa  122  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  38.07 
 
 		 198 aa  122  8e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 247 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  40.8 
 
 		 211 aa  119  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 222 aa  118  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  40.65 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  40.23 
 
 		 210 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 245 aa  116  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 		 263 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  36.16 
 
 		 204 aa  115  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  40.23 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  39.35 
 
 		 197 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  39.53 
 
 		 211 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  37.87 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  27.42 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  28.69 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  37.44 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 294 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  34.02 
 
 		 269 aa  107  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  38.43 
 
 		 265 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  35.63 
 
 		 210 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  37.06 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  33.75 
 
 		 252 aa  99  7e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  27.24 
 
 		 272 aa  93.6  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.54 
 
 		 349 aa  92.8  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  30.05 
 
 		 207 aa  92  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 		 263 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  30.05 
 
 		 207 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  30.93 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  30.93 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  29.53 
 
 		 207 aa  90.5  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 349 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  26.05 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.67 
 
 		 335 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 		 535 aa  86.7  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 		 293 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  27.72 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 230 aa  82.4  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.71 
 
 		 242 aa  82  0.000000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 		 262 aa  76.3  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>