More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1523 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 279 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  48.33 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  46.47 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  46.78 
 
 		 241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  43.18 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  44.12 
 
 		 248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  30.42 
 
 		 263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 		 236 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 240 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  42.11 
 
 		 282 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  36.31 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  38.27 
 
 		 254 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  39.26 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  42.42 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 		 253 aa  114  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.43 
 
 		 265 aa  112  9e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  37.89 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.45 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 236 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  40.94 
 
 		 228 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  38.15 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 		 221 aa  106  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 		 293 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  37.64 
 
 		 241 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  34.56 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 231 aa  102  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 		 232 aa  99  8e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  36.09 
 
 		 349 aa  99  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  34.01 
 
 		 232 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 		 255 aa  97.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 348 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  34.08 
 
 		 242 aa  97.1  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  37.08 
 
 		 339 aa  96.7  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  40.12 
 
 		 173 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 349 aa  95.5  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  36.63 
 
 		 263 aa  94.7  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 262 aa  94.4  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 229 aa  93.6  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  29.69 
 
 		 256 aa  92.8  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  30.93 
 
 		 220 aa  92.8  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  29.49 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0776  hypothetical protein  22.22 
 
 		 239 aa  91.7  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.739404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  36.69 
 
 		 354 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.65 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 220 aa  91.3  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 228 aa  90.1  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  30.68 
 
 		 218 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  31.84 
 
 		 275 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  35.29 
 
 		 217 aa  90.1  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  31.77 
 
 		 220 aa  89.7  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  32.95 
 
 		 241 aa  89.7  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 		 256 aa  89.4  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  30.23 
 
 		 217 aa  89  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  30.23 
 
 		 216 aa  89  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 		 671 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 		 671 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  31.12 
 
 		 210 aa  88.2  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 335 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 		 288 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.65 
 
 		 244 aa  87.4  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  34.06 
 
 		 671 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 664 aa  85.9  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 		 267 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 		 224 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  29.07 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.07 
 
 		 219 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  29.07 
 
 		 217 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  37.2 
 
 		 876 aa  84.3  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 255 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 260 aa  83.6  0.000000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1068  twin-arginine translocation pathway signal  28.89 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  28.64 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  28.26 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  29.07 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  35.06 
 
 		 270 aa  84  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.43 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0234  hypothetical protein  26.51 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  32.32 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  30 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 		 196 aa  83.2  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  24.86 
 
 		 234 aa  82.4  0.000000000000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  27.91 
 
 		 217 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  29.49 
 
 		 252 aa  82  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.33 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  29.49 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  31.35 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.33 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  27.91 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.66 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>