231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5634 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
238 aa  477  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  72.68 
 
 
270 aa  280  2e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  37.87 
 
 
237 aa  156  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  36.02 
 
 
237 aa  142  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.84 
 
 
252 aa  124  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  35.1 
 
 
247 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  38.61 
 
 
254 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.47 
 
 
330 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  34.04 
 
 
276 aa  116  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  31.47 
 
 
254 aa  115  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  39.68 
 
 
192 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  39.18 
 
 
276 aa  114  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  41.82 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  36.84 
 
 
276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 
256 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  32.71 
 
 
276 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  34.93 
 
 
230 aa  97.8  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  30.29 
 
 
264 aa  95.9  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 
244 aa  92.4  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  29.92 
 
 
296 aa  91.3  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 
231 aa  90.9  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 
299 aa  89.4  4e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  35.71 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  32.26 
 
 
257 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 
221 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
236 aa  82  0.000000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
316 aa  81.6  0.000000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  34.16 
 
 
248 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
220 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  34.13 
 
 
282 aa  79.7  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30.43 
 
 
279 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  35.09 
 
 
291 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  28.85 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  29.66 
 
 
257 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  26.89 
 
 
232 aa  77  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 
281 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  30.86 
 
 
290 aa  77  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.43 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
275 aa  71.6  0.000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  41.11 
 
 
307 aa  71.6  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  35.24 
 
 
876 aa  71.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  32.46 
 
 
337 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  33.53 
 
 
255 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 
339 aa  68.6  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.14 
 
 
349 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.22 
 
 
242 aa  67.8  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  27.91 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 
348 aa  67.8  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.5 
 
 
624 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
241 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 
269 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3762  hypothetical protein  24.76 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  32.96 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  31.75 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 
217 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
265 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  25.69 
 
 
250 aa  64.7  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  26.29 
 
 
214 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  25.36 
 
 
217 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  25.84 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  29.11 
 
 
227 aa  63.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 
671 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  24.66 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 
247 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  24.32 
 
 
216 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.51 
 
 
671 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 
285 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  24.32 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 
664 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  25.1 
 
 
279 aa  62.8  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  23.38 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.74 
 
 
233 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.16 
 
 
307 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.22 
 
 
217 aa  62  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 
220 aa  62  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  25.36 
 
 
219 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  28.3 
 
 
282 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
219 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  24.4 
 
 
217 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  25.36 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  26.07 
 
 
228 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  25.36 
 
 
217 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 
335 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>