57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3439 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  40.22 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  38.25 
 
 		 566 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  36 
 
 		 248 aa  102  6e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  33.5 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  28.51 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  28.51 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  28.51 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  32.83 
 
 		 257 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  32.6 
 
 		 254 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.08 
 
 		 252 aa  84  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  31.09 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  32.28 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  34.23 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  28.26 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  28.63 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  27.13 
 
 		 276 aa  73.2  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  36.6 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  27.48 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  31.5 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  32.53 
 
 		 290 aa  67.8  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 270 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.74 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  26.88 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 316 aa  64.3  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  26.32 
 
 		 247 aa  63.5  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  33.06 
 
 		 255 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  32.48 
 
 		 277 aa  62.4  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  29.18 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  26.74 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  29.82 
 
 		 319 aa  58.9  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  26.96 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  32.74 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  29.44 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 244 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  30.83 
 
 		 312 aa  50.1  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.39 
 
 		 231 aa  48.9  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  25.93 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.23 
 
 		 330 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 241 aa  45.4  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  28.83 
 
 		 276 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  26.83 
 
 		 282 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 299 aa  43.1  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  31.13 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  22.68 
 
 		 219 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>