47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 277 aa  541  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  47.45 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  40.49 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 276 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  30.58 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  40.07 
 
 		 316 aa  133  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  36.51 
 
 		 312 aa  132  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  34.67 
 
 		 264 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 		 296 aa  113  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  31.52 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 291 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.11 
 
 		 252 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  39.89 
 
 		 255 aa  86.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  30.4 
 
 		 257 aa  85.5  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  29.15 
 
 		 257 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 244 aa  82.4  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  34.68 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  29.29 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  34.68 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  34.68 
 
 		 252 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  37.29 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  29.96 
 
 		 268 aa  77  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  36.2 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  29.5 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  34.64 
 
 		 221 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.29 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  37.6 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  32.48 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  30.11 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  29.8 
 
 		 276 aa  60.1  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  34.19 
 
 		 566 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  28.73 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  30.07 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  25.3 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  34.29 
 
 		 254 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  30.67 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  28.65 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  25.75 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  25.75 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  25.75 
 
 		 220 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  27.53 
 
 		 337 aa  42.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>