More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0913 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 270 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  72.25 
 
 		 238 aa  297  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  38.24 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  36.78 
 
 		 237 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  39.43 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.14 
 
 		 330 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  38.78 
 
 		 244 aa  122  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  41.92 
 
 		 192 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  37.58 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  33.05 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  34.89 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.75 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  31.64 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  37.42 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  37.58 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  28.68 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  32.24 
 
 		 276 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  28.47 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  30.5 
 
 		 276 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  30.84 
 
 		 257 aa  94  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  28.06 
 
 		 290 aa  91.7  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  32.16 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  31.62 
 
 		 257 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 		 214 aa  86.3  5e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  33.93 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  33.93 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  33.93 
 
 		 252 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.65 
 
 		 876 aa  82.4  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  36.47 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  27.32 
 
 		 216 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  30.3 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  24.81 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 		 254 aa  79  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 217 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  28.46 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  31.76 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.93 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  26.67 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.29 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  25.77 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.29 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  32.58 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 664 aa  75.5  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.29 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  25.77 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  29.38 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  27.95 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  35.37 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.29 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  29.78 
 
 		 270 aa  74.3  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  31.29 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  31.55 
 
 		 248 aa  72.4  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.76 
 
 		 217 aa  72  0.000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.52 
 
 		 307 aa  72  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  25.77 
 
 		 217 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 268 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  34.88 
 
 		 652 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 248 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  26.59 
 
 		 279 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 671 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  31.17 
 
 		 269 aa  70.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 671 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.14 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 307 aa  70.1  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.17 
 
 		 244 aa  68.9  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  34.76 
 
 		 671 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 		 218 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  34.3 
 
 		 652 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  26.74 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  30.85 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  32.05 
 
 		 616 aa  67.4  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  20.9 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.44 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  35.03 
 
 		 629 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  25.65 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.24 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  26.07 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  24.27 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 285 aa  65.5  0.0000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 173 aa  65.1  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>