114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5533 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  100 
 
 
192 aa  387  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  51.98 
 
 
237 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  51.41 
 
 
237 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  37.08 
 
 
252 aa  132  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  39.89 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  40.11 
 
 
270 aa  121  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  38.22 
 
 
291 aa  116  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  39.68 
 
 
238 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  40.69 
 
 
296 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  41.61 
 
 
276 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  39.26 
 
 
276 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  37.2 
 
 
247 aa  104  7e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  37.71 
 
 
275 aa  97.8  9e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  37.36 
 
 
268 aa  97.8  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
316 aa  93.2  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  34.23 
 
 
254 aa  88.6  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
244 aa  88.6  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  33.52 
 
 
244 aa  88.2  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  32.18 
 
 
264 aa  87.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.64 
 
 
330 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  35.06 
 
 
254 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  34.57 
 
 
257 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  34.1 
 
 
312 aa  85.5  4e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 
256 aa  84.7  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 
231 aa  84.3  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  33.54 
 
 
276 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  37.89 
 
 
277 aa  84  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  36.36 
 
 
257 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  30.53 
 
 
285 aa  78.2  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  31.74 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  33.33 
 
 
252 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.82 
 
 
307 aa  72  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  30.81 
 
 
323 aa  72  0.000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  36.55 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  29.38 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  27.59 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  38.71 
 
 
337 aa  65.5  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  33.76 
 
 
276 aa  65.1  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  62.4  0.000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  30.43 
 
 
566 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.38 
 
 
232 aa  58.5  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
250 aa  57.8  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  29.59 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  29.59 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  28.32 
 
 
229 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  29.59 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 
242 aa  56.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  28.28 
 
 
220 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  27.08 
 
 
221 aa  55.8  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  35.04 
 
 
326 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 
265 aa  55.1  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
248 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.29 
 
 
247 aa  54.3  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  28.77 
 
 
279 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  27.68 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.03 
 
 
216 aa  52  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.89 
 
 
228 aa  51.6  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  26.03 
 
 
335 aa  51.6  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  25.86 
 
 
223 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  26.23 
 
 
324 aa  51.2  0.000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
172 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  22.99 
 
 
214 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  23.56 
 
 
263 aa  49.3  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  27.81 
 
 
241 aa  49.7  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 
229 aa  48.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  31.18 
 
 
276 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 
265 aa  48.1  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 
664 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 
269 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  23.61 
 
 
236 aa  47.4  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 
307 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  32.53 
 
 
251 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  25.71 
 
 
241 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  26.79 
 
 
279 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  22.76 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  23.78 
 
 
299 aa  46.2  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  25.32 
 
 
409 aa  46.2  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  24.14 
 
 
254 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  24.24 
 
 
233 aa  44.7  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
268 aa  44.7  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  22.15 
 
 
219 aa  44.7  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
232 aa  44.7  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  26.95 
 
 
390 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 
220 aa  44.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 
339 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  26.78 
 
 
223 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  25.5 
 
 
220 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  25.75 
 
 
390 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  26.38 
 
 
411 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  28.48 
 
 
311 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.85 
 
 
244 aa  43.5  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 
241 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 
267 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  25.85 
 
 
293 aa  43.9  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
209 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>