123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0412 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
276 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  37.9 
 
 
312 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  35.11 
 
 
276 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  36.93 
 
 
285 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  35.09 
 
 
264 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  42.21 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  44.72 
 
 
277 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 
296 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  38.73 
 
 
244 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  39.43 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.64 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  41.61 
 
 
192 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
246 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
238 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 
270 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.85 
 
 
252 aa  97.1  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  32.03 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  33.93 
 
 
240 aa  90.5  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  38.15 
 
 
244 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  26.41 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  32.78 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  27.47 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  29.3 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  33.81 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  30.41 
 
 
257 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  32 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  26.58 
 
 
326 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  27.83 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 
230 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  34.62 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  29.56 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  29.34 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  27.94 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.03 
 
 
330 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  25 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  29.86 
 
 
337 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  27.07 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  30 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  30.67 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  29.19 
 
 
319 aa  67  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.94 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 
248 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  33.04 
 
 
566 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  31.21 
 
 
255 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  24.02 
 
 
217 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  29.71 
 
 
299 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  27.62 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.88 
 
 
241 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  26.28 
 
 
216 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  27.39 
 
 
276 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  27.75 
 
 
281 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  26.28 
 
 
216 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  26.28 
 
 
217 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 
242 aa  57  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
254 aa  56.2  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 
262 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  24.2 
 
 
217 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  22.17 
 
 
219 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  30.77 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
275 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 
307 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  25 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  25 
 
 
219 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  28.99 
 
 
229 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  23.96 
 
 
243 aa  52.4  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 
255 aa  52  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  29.41 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  28.86 
 
 
282 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
218 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 
172 aa  51.2  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  30.16 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  23.72 
 
 
219 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 
255 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  37.14 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  23.94 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
220 aa  48.9  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  23.27 
 
 
199 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  23.27 
 
 
199 aa  48.5  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  28.75 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  24.19 
 
 
241 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  25.13 
 
 
228 aa  47  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  24.46 
 
 
269 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 
236 aa  46.2  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  22.58 
 
 
339 aa  46.2  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
196 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  25.47 
 
 
173 aa  45.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  23.42 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  22.97 
 
 
218 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  26.74 
 
 
282 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  22.95 
 
 
246 aa  43.9  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>