154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1353 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 244 aa  489  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  38.75 
 
 		 276 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  37.78 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  32.89 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 296 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  33.64 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  31.63 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  30.36 
 
 		 276 aa  94.7  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 285 aa  89.4  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 238 aa  88.6  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.37 
 
 		 252 aa  86.3  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  33.9 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.18 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  30.14 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  30.65 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  38.31 
 
 		 277 aa  81.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  34.52 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  35.86 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  27.13 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  29.63 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  30.05 
 
 		 257 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  30.34 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  29.58 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.34 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  32.09 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  31.61 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  32.08 
 
 		 276 aa  71.6  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.74 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  30.17 
 
 		 240 aa  71.2  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  29 
 
 		 247 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  34.52 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  34.52 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  34.52 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  31.14 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  33.71 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  25 
 
 		 279 aa  63.2  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  28.72 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  30.62 
 
 		 255 aa  62  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 231 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  25.44 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.18 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  32.67 
 
 		 629 aa  58.5  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  28.32 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.11 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.57 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  26.73 
 
 		 216 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  25.63 
 
 		 337 aa  56.2  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.09 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  26.24 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  26.09 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.11 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.09 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 354 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 218 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 188 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  27.06 
 
 		 566 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 288 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  25.49 
 
 		 282 aa  53.1  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  25.44 
 
 		 279 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  28.74 
 
 		 652 aa  52.4  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  33.06 
 
 		 229 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  26.84 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  26.84 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  25.15 
 
 		 251 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28 
 
 		 624 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.83 
 
 		 652 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  27.71 
 
 		 270 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 254 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  24.85 
 
 		 268 aa  48.9  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  25.26 
 
 		 335 aa  48.9  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  28.75 
 
 		 411 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  31.09 
 
 		 227 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  28.89 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 172 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  24.58 
 
 		 236 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  27.74 
 
 		 173 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  29.85 
 
 		 323 aa  46.6  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  25.66 
 
 		 335 aa  46.6  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  26.37 
 
 		 256 aa  46.6  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.625994 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>