155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1010 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
237 aa  486  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  81.78 
 
 
237 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  51.98 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  40.48 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  37.45 
 
 
252 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  35.27 
 
 
246 aa  137  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  38.58 
 
 
270 aa  132  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  35.81 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  37.7 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  35.68 
 
 
276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  32.59 
 
 
276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  31.56 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  37.87 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  29.22 
 
 
264 aa  105  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  34.03 
 
 
316 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  34.55 
 
 
296 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  34.91 
 
 
256 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  35.14 
 
 
254 aa  98.2  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  28.89 
 
 
257 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  29.71 
 
 
248 aa  91.3  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 
268 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  27.98 
 
 
257 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  34.78 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  34.78 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  34.78 
 
 
252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  28.84 
 
 
285 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  33.55 
 
 
290 aa  87  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 
244 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  28.8 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  25.31 
 
 
330 aa  84  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.09 
 
 
307 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  32.69 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  32.95 
 
 
276 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  32.04 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  33.33 
 
 
255 aa  75.1  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  30.61 
 
 
282 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  28.42 
 
 
319 aa  72  0.000000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 
312 aa  71.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
230 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  31.55 
 
 
277 aa  70.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  26.89 
 
 
279 aa  70.1  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.82 
 
 
233 aa  68.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 
265 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.79 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  28 
 
 
223 aa  64.7  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 
409 aa  65.1  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  27.43 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.36 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  30.36 
 
 
223 aa  62.8  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  26.26 
 
 
323 aa  62.4  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  30.35 
 
 
337 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  25.84 
 
 
349 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 
335 aa  60.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  33.61 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  25.45 
 
 
232 aa  60.5  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 
339 aa  60.1  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  25.62 
 
 
307 aa  60.1  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  24.18 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  25.28 
 
 
348 aa  58.5  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  26.83 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
219 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  32.77 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  28.97 
 
 
279 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.21 
 
 
216 aa  57.4  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  25.28 
 
 
349 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  28.45 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  28.57 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  28.57 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  27.1 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 
335 aa  54.7  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  30.94 
 
 
229 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  22.62 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 
276 aa  54.7  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.92 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  28.99 
 
 
566 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  27.06 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.52 
 
 
664 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 
251 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  29.38 
 
 
876 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.39 
 
 
220 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
299 aa  53.5  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 
232 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.87 
 
 
241 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 
229 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  30.19 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  25.81 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  24 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  22.5 
 
 
313 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  27.36 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>