More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5558 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
248 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  41.78 
 
 
299 aa  161  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  41.29 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  41.95 
 
 
281 aa  144  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  42.24 
 
 
230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  44.12 
 
 
279 aa  132  5e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  43.72 
 
 
282 aa  130  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 
268 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
242 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
231 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  30.74 
 
 
232 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.2 
 
 
247 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
254 aa  105  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 
263 aa  104  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.39 
 
 
240 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  31.43 
 
 
221 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
214 aa  102  6e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  34.8 
 
 
251 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  30.66 
 
 
251 aa  99.8  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.82 
 
 
219 aa  97.1  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 
236 aa  96.3  4e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  35.59 
 
 
349 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.94 
 
 
265 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  27.8 
 
 
241 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.94 
 
 
348 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 
349 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 
220 aa  87.8  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.76 
 
 
232 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.55 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  30.05 
 
 
284 aa  87  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
263 aa  87.4  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.07 
 
 
252 aa  86.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  30.33 
 
 
210 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  37.06 
 
 
664 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 
217 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
671 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  27.32 
 
 
275 aa  83.6  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.62 
 
 
671 aa  84  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 
210 aa  83.2  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  29.55 
 
 
339 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  31.87 
 
 
270 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.48 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 
241 aa  79  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  35.1 
 
 
671 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 
335 aa  78.6  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  30.72 
 
 
624 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.46 
 
 
244 aa  76.6  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  30.52 
 
 
232 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.05 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.05 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 
172 aa  74.7  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
288 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.14 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  28.38 
 
 
216 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  31.14 
 
 
204 aa  74.3  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  27.67 
 
 
270 aa  73.6  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  30.57 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  33.53 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  32.93 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  29.56 
 
 
238 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
218 aa  72.4  0.000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.38 
 
 
219 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  30.61 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  30.61 
 
 
261 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.95 
 
 
211 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  27.03 
 
 
216 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  31.11 
 
 
211 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  27.03 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  27.03 
 
 
219 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  27.03 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.56 
 
 
876 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  28.33 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  27.53 
 
 
276 aa  69.7  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  27.03 
 
 
217 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.33 
 
 
217 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 
210 aa  68.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  27.52 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2411  disulfide bond formation protein  28.48 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  26.09 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  27.52 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
269 aa  68.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  30.67 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>