38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2061 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  36.02 
 
 
276 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 
285 aa  122  8e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  30.14 
 
 
264 aa  107  3e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  28.3 
 
 
277 aa  99  8e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  25 
 
 
276 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  26.12 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  26.44 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  23.24 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  31.65 
 
 
337 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  26.92 
 
 
290 aa  63.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 
312 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  30.14 
 
 
268 aa  62  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  24.06 
 
 
323 aa  60.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  27.34 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  25.12 
 
 
319 aa  56.2  0.0000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  24.9 
 
 
276 aa  55.8  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 
291 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  30.23 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  23.46 
 
 
246 aa  50.8  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  22.97 
 
 
252 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  23.39 
 
 
244 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  24 
 
 
256 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  27.11 
 
 
252 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  27.11 
 
 
252 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  27.11 
 
 
252 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  28.19 
 
 
221 aa  47  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  27.17 
 
 
257 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  22.08 
 
 
238 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  25.48 
 
 
243 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3762  hypothetical protein  27.35 
 
 
258 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  26.21 
 
 
207 aa  43.5  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  26.79 
 
 
192 aa  43.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.83 
 
 
200 aa  42.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  26.4 
 
 
257 aa  42  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  25.52 
 
 
207 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>