68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2163 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  521  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  88.48 
 
 
257 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  71.71 
 
 
252 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  71.71 
 
 
252 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  71.71 
 
 
252 aa  344  8.999999999999999e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  60.64 
 
 
255 aa  289  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  35.67 
 
 
244 aa  112  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  37.25 
 
 
290 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.96 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.73 
 
 
307 aa  90.1  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 
237 aa  89.4  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  30.67 
 
 
276 aa  88.2  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  40 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 
237 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  27.87 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  33.97 
 
 
270 aa  85.9  5e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  34.78 
 
 
264 aa  85.1  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  28.78 
 
 
246 aa  82.4  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 
291 aa  79.7  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  32.28 
 
 
254 aa  79.7  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  34 
 
 
277 aa  78.2  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  33.93 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  36.54 
 
 
238 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  27.11 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.95 
 
 
192 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  25.77 
 
 
330 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  33.85 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 
256 aa  68.6  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  35.1 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  27.35 
 
 
276 aa  65.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  26.88 
 
 
324 aa  64.3  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  23.15 
 
 
247 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  24.02 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02600  protein-disulfide isomerase  27.04 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  27.56 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  27.56 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  28.57 
 
 
566 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  27.56 
 
 
220 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 
218 aa  59.7  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  31.2 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  27.43 
 
 
319 aa  58.9  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  26.54 
 
 
282 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  30 
 
 
223 aa  55.8  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1143  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 
312 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  27.64 
 
 
323 aa  51.2  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  24.64 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  24.64 
 
 
218 aa  48.9  0.00008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
217 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  27.17 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 
243 aa  46.2  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3534  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  25.39 
 
 
286 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  25.31 
 
 
228 aa  46.2  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4610  disulfide isomerase/thiol-disulfide oxidase  25.39 
 
 
276 aa  45.8  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  25.79 
 
 
220 aa  45.4  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  23.33 
 
 
313 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3229  twin-arginine translocation pathway signal  25.81 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.812734  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  22.67 
 
 
281 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 
242 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 
248 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  24.72 
 
 
230 aa  42.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 
231 aa  42  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>