155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_07810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  100 
 
 		 268 aa  546  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  44.03 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  37.96 
 
 		 238 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  35.64 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  32.27 
 
 		 237 aa  99.8  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  38.16 
 
 		 252 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  37.36 
 
 		 192 aa  97.8  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 		 246 aa  95.9  6e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  31.05 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  32.66 
 
 		 276 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  30.53 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  34.66 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  34.66 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  34.66 
 
 		 252 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  33.49 
 
 		 337 aa  86.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 276 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  29.08 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3002  hypothetical protein  32.31 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  28.07 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  31.22 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  31.01 
 
 		 256 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  29.2 
 
 		 257 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  26.11 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.98 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  33.33 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  28.32 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12984  membrane or secreted protein  34.09 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  27.45 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  26.48 
 
 		 242 aa  75.1  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  31.14 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  23.14 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  32.09 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  30.8 
 
 		 279 aa  72.4  0.000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11761  transmembrane serine/threonine-protein kinase E pknE  28.8 
 
 		 566 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0189066 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  22.66 
 
 		 255 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  28.27 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  28.27 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  28.27 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  26.17 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  31.1 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  34.07 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  38.1 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 296 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  28.34 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  28.1 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  27.65 
 
 		 244 aa  63.9  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  31.12 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  26.75 
 
 		 248 aa  62  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  32.68 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  25.54 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  31.09 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 		 339 aa  59.3  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0977  hypothetical protein  28.79 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.208676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  31.46 
 
 		 281 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2325  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.597314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  24.52 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  32.42 
 
 		 616 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  57  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  22.37 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  22.37 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 		 241 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  20.45 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  28.11 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  28.24 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  22.92 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  28.24 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  22.37 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  31.29 
 
 		 624 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 348 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  25.16 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  30.23 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  22.37 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 240 aa  53.1  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 671 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  25.63 
 
 		 671 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.98 
 
 		 349 aa  52.4  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  38.2 
 
 		 254 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  22.37 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 664 aa  52  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  24.26 
 
 		 250 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 349 aa  52.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  22.37 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  26.35 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  24.7 
 
 		 216 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  25.64 
 
 		 220 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  21.92 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  32.82 
 
 		 251 aa  51.2  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>