95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2963 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2963  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 275 aa  539  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  35.78 
 
 		 276 aa  130  3e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31660  hypothetical protein  33.97 
 
 		 276 aa  107  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  30.8 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07550  hypothetical protein  31.54 
 
 		 264 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  34.22 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5533  Protein-disulfide isomerase-like protein  38.61 
 
 		 192 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276962 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1342  DSBA oxidoreductase  28.33 
 
 		 246 aa  92.8  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.882683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1454  protein-disulfide isomerase-like protein  28.51 
 
 		 247 aa  92  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5780  Protein-disulfide isomerase-like protein  29.33 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.271586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2947  DSBA oxidoreductase  30.52 
 
 		 285 aa  86.7  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0412  DSBA oxidoreductase  34.36 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.122901  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0799  DSBA oxidoreductase  30.83 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0127879 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0753  DSBA oxidoreductase  27.44 
 
 		 296 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2943  hypothetical protein  24.77 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0768029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2061  hypothetical protein  27.38 
 
 		 279 aa  77.4  0.0000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5634  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  32.81 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0913  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.717138  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3171  hypothetical protein  30.65 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.653827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04010  protein-disulfide isomerase  27.91 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172438  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0870  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3281  integral membrane protein  26.09 
 
 		 276 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.59765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  26.49 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31680  protein-disulfide isomerase  39.2 
 
 		 277 aa  69.3  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0955  protein-disulfide isomerase-like protein  32.47 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1168  hypothetical protein  31.61 
 
 		 337 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2871  DSBA oxidoreductase  28.73 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000669045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1224  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  25.41 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0749  hypothetical protein  33.97 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.338551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0769  hypothetical protein  33.97 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0755  hypothetical protein  33.97 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07810  protein-disulfide isomerase  32.89 
 
 		 268 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 335 aa  63.2  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5706  Protein-disulfide isomerase-like protein  24.56 
 
 		 330 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0067  hypothetical protein  28.64 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0337879 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0066  hypothetical protein  24.53 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0355055 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3439  hypothetical protein  27.98 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62534  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  25.82 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  25.79 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  21.58 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 214 aa  55.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.44 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0679  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 312 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  24.68 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1353  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 244 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 255 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4202  hypothetical protein  27.9 
 
 		 257 aa  53.1  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.270054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 241 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  26.11 
 
 		 200 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0031  putative integral membrane protein  27.27 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  24.2 
 
 		 200 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2163  hypothetical protein  27.07 
 
 		 257 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1454  protein-disulfide isomerase  27.72 
 
 		 324 aa  48.5  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0026  hypothetical protein  24.87 
 
 		 433 aa  48.1  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727163  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  25.52 
 
 		 226 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  25.2 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1686  Protein-disulfide isomerase-like protein  33.6 
 
 		 307 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183899  normal  0.0533291 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0283  DsbA-like thioredoxin  28.78 
 
 		 232 aa  47  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.144264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5707  integral membrane protein  31.39 
 
 		 282 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.870956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  26.03 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5261  hypothetical protein  30.5 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.98331  normal  0.264053 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 		 232 aa  45.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0953  thiol:disulfide interchange protein  26.28 
 
 		 218 aa  45.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.452508  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  27.06 
 
 		 227 aa  45.4  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 242 aa  45.4  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1058  putative disulfide bond formation protein D  25.45 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.745592  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  32.39 
 
 		 671 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.95 
 
 		 211 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  29.41 
 
 		 222 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  25.68 
 
 		 265 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  27.16 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 204 aa  43.5  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  26.92 
 
 		 217 aa  43.5  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 254 aa  43.1  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 211 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 		 211 aa  42.7  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  25.27 
 
 		 199 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  34.53 
 
 		 336 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  35.92 
 
 		 210 aa  42.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  22.22 
 
 		 207 aa  42.4  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 671 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2482  putative lipoprotein  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.135487  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2434  protein-disulfide isomerase-like protein  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.426803  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1921  hypothetical protein  30.92 
 
 		 252 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.594897 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1987  hypothetical protein  30.92 
 
 		 252 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1941  hypothetical protein  30.92 
 
 		 252 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  29.7 
 
 		 349 aa  42  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>