200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0044 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0044  thiol/disulfide interchange protein DsbA precursor  100 
 
 		 207 aa  431  1e-120  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00404  disulfide bond formation protein  68.02 
 
 		 200 aa  292  2e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2485  thiol:disulfide interchange protein  64.47 
 
 		 200 aa  290  7e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002045  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  67.01 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3156  thiol:disulfide interchange protein DsbA  58 
 
 		 200 aa  253  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05306  thiol:disulfide interchange protein DsbA  54.31 
 
 		 211 aa  235  3e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000576  periplasmic thiol:disulfide interchange protein DsbA  54.35 
 
 		 199 aa  227  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0848173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3620  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.5 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.68 
 
 		 207 aa  161  7e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4518  periplasmic protein disulfide isomerase I  38.21 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4165  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.1 
 
 		 207 aa  154  9e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0407831  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3968  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000322053  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03746  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.468717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4126  DSBA oxidoreductase  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4083  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000727288  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4155  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00383633  hitchhiker  0.0000667168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4332  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5300  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.038843  normal  0.694911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4378  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000586255  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03695  hypothetical protein  36.84 
 
 		 208 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.459554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4241  periplasmic protein disulfide isomerase I  36.84 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0131889  normal  0.281037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4889  periplasmic protein disulfide isomerase I  37.86 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000138937  hitchhiker  0.000000639801 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4196  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.693505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0020  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000268168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0265  DSBA oxidoreductase  40 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0786438  hitchhiker  0.00413273 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0022  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00595683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4104  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  148  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00283227  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4228  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157644  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4278  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.744084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4324  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.954337 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4385  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25464  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4207  periplasmic protein disulfide isomerase I  35.89 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0285  DSBA oxidoreductase  37.91 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000120149  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3656  DSBA oxidoreductase  37.57 
 
 		 202 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3838  DSBA oxidoreductase  36.56 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0311  DSBA oxidoreductase  37.19 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.126539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0400  DSBA oxidoreductase  36.67 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0410  DSBA oxidoreductase  37.08 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.247537  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3321  thiol:disulfide interchange protein DsbA  39.25 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0146564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3642  DSBA oxidoreductase  35.83 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.190488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0302  DSBA oxidoreductase  35.83 
 
 		 203 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.496912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4193  DsbA oxidoreductase  35.18 
 
 		 203 aa  141  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000377702  normal  0.608674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0333  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.29 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4153  DSBA oxidoreductase  37.22 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4035  DSBA oxidoreductase  37.22 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3958  DSBA oxidoreductase  37.22 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4060  DSBA oxidoreductase  37.22 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.154818  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4348  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.73 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3575  DSBA oxidoreductase  33.5 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0748  DSBA oxidoreductase  35.78 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.309813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1579  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.555105  hitchhiker  0.00803379 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03648  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.33 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1512  DSBA oxidoreductase  34.63 
 
 		 207 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00919562 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2860  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  34.78 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1573  DSBA oxidoreductase  34.15 
 
 		 217 aa  118  7e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0257  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.2 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.901513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2373  DSBA oxidoreductase  36.06 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.563434  hitchhiker  0.0000192462 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0308  protein disulfide-isomerase (thiol:disulfide interchange protein)  35.58 
 
 		 202 aa  112  6e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2842  DSBA oxidoreductase  32.97 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000181204 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1521  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  33.33 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0606575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1709  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000128483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2640  DSBA oxidoreductase  30.73 
 
 		 206 aa  103  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0686  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 220 aa  102  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.355761 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1742  DsbA oxidoreductase  31.87 
 
 		 210 aa  101  9e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0147318  hitchhiker  0.0000164323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2360  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2675  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.26469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2754  DSBA oxidoreductase  30.24 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbA  31.34 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.405724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3787  DsbA oxidoreductase  28.57 
 
 		 249 aa  99  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0120  hypothetical protein  31.89 
 
 		 206 aa  98.2  7e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0077  hypothetical protein  29.32 
 
 		 293 aa  96.7  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.453985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0129  DSBA oxidoreductase  31.35 
 
 		 206 aa  96.3  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2167  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 233 aa  94.7  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6288  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.1 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72450  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.1 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.568444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3036  DSBA oxidoreductase  28.5 
 
 		 250 aa  94.4  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0983  DSBA oxidoreductase  26.2 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3718  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  28.24 
 
 		 250 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0050  DSBA oxidoreductase  30.3 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0556342  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0142  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 210 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0551  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 220 aa  90.9  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5101  DSBA oxidoreductase  31 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0488086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3118  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.973295  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3063  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0203251 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0909  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.322107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0874  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 250 aa  89.4  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.117334  normal  0.991367 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4228  DSBA oxidoreductase  27.89 
 
 		 221 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.210811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1693  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1364  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 214 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 211 aa  88.6  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2921  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2936  DSBA oxidoreductase  30.18 
 
 		 212 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3568  DSBA oxidoreductase  26.88 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47204  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2784  thiol:disulfide interchange protein DsbA  29.95 
 
 		 216 aa  87.8  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.957137  normal  0.939169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0975  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 251 aa  87.8  9e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0127  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  29.52 
 
 		 210 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0463  DSBA oxidoreductase  25.59 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0780144  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2307  DSBA oxidoreductase  29.59 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3398  DSBA oxidoreductase  27.57 
 
 		 251 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>