More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1670 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
240 aa  492  9.999999999999999e-139  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  52.21 
 
 
247 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  56.52 
 
 
265 aa  237  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  46.77 
 
 
265 aa  235  4e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  46.46 
 
 
263 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  42 
 
 
263 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  35.32 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  34.43 
 
 
253 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  37.17 
 
 
268 aa  138  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 
242 aa  138  6e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  38.1 
 
 
269 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  36.27 
 
 
220 aa  137  2e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  38.29 
 
 
232 aa  136  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  37.69 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  34.86 
 
 
219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  36.48 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  36.32 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  36 
 
 
335 aa  130  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  32.31 
 
 
236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  38.32 
 
 
214 aa  126  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.62 
 
 
349 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.19 
 
 
348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  35.6 
 
 
284 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.19 
 
 
349 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.6 
 
 
255 aa  113  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  30.21 
 
 
243 aa  112  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 
354 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  32.85 
 
 
219 aa  107  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.78 
 
 
279 aa  106  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  31.89 
 
 
241 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.7 
 
 
293 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  35.17 
 
 
335 aa  104  1e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  29.92 
 
 
229 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 
246 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  35.36 
 
 
671 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  35.36 
 
 
671 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  34.24 
 
 
251 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  31.21 
 
 
251 aa  101  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
220 aa  101  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  33.7 
 
 
230 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  32.94 
 
 
231 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  34.81 
 
 
671 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  30.93 
 
 
254 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  29.35 
 
 
228 aa  99.4  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  32.92 
 
 
227 aa  99  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4372  twin-arginine translocation pathway signal  32.22 
 
 
233 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0746348  normal  0.0437903 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  31.25 
 
 
216 aa  99.4  5e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 
214 aa  99  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  39.33 
 
 
243 aa  98.6  8e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 
269 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  32.7 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  34.25 
 
 
229 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.84 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  28.51 
 
 
241 aa  95.9  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  31.45 
 
 
234 aa  95.5  6e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3249  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
217 aa  95.5  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115569  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2319  twin-arginine translocation signal domain-containing protein  30.17 
 
 
218 aa  95.1  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  28.95 
 
 
210 aa  94.7  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  35.36 
 
 
664 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  26.94 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2785  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2095  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.8374  normal  0.160886 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  30.6 
 
 
242 aa  93.2  4e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  31.1 
 
 
616 aa  93.2  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
236 aa  92.8  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0014  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.53 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.638568  hitchhiker  0.0000141764 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  27.97 
 
 
248 aa  92.8  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  35.95 
 
 
311 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  29.84 
 
 
244 aa  92.4  6e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  35.95 
 
 
311 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
224 aa  92  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  34.52 
 
 
876 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 
182 aa  91.7  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3501  DsbA oxidoreductase  30.9 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0656  DSBA oxidoreductase  26.48 
 
 
256 aa  91.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.625994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3177  DsbA oxidoreductase  30.9 
 
 
217 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  30.1 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3372  DsbA oxidoreductase  30.9 
 
 
217 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145416  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0692  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 
228 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.440532 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  32.2 
 
 
282 aa  89.7  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  34.59 
 
 
225 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  30.58 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  28.09 
 
 
281 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  29.85 
 
 
624 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  30.88 
 
 
553 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 
179 aa  89  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2607  protein-disulfide isomerase  29.12 
 
 
220 aa  88.6  9e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.37764  normal  0.194892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 
219 aa  88.2  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  33.99 
 
 
311 aa  87.4  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1382  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
276 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  40.43 
 
 
298 aa  87.8  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 
173 aa  87.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  32.1 
 
 
652 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  31.28 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>