More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_24710 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_24710  protein-disulfide isomerase  100 
 
 
282 aa  556  1e-157  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.374857  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  53.73 
 
 
299 aa  256  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  47.73 
 
 
281 aa  168  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  41.9 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5558  DSBA oxidoreductase  38.66 
 
 
248 aa  137  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.838875  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  41.92 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  42.11 
 
 
279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  29.69 
 
 
269 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  33.51 
 
 
268 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
240 aa  101  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0639  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 
220 aa  98.6  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
214 aa  95.9  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.75 
 
 
349 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  29.6 
 
 
263 aa  94  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
348 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 
349 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  32.54 
 
 
236 aa  90.5  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 
221 aa  88.6  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  33.09 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  33.09 
 
 
261 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  32.52 
 
 
219 aa  87  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.89 
 
 
265 aa  85.1  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  29.24 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  29.24 
 
 
217 aa  82.8  0.000000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  29.24 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1661  DSBA oxidoreductase  32 
 
 
251 aa  82.4  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396912 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  28.65 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  29.24 
 
 
219 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  29.24 
 
 
217 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  28.07 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  28.07 
 
 
216 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  29.28 
 
 
236 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  31.36 
 
 
664 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1292  DSBA oxidoreductase  32.39 
 
 
254 aa  79.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  33.09 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  28.65 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  31.98 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3717  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 
242 aa  79.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  29.17 
 
 
296 aa  79  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 
217 aa  79  0.00000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 
242 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.82 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 
257 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.9 
 
 
262 aa  77  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  27.86 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  27.86 
 
 
252 aa  77  0.0000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.22 
 
 
293 aa  77  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1140  protein-disulfide isomerase-like protein  33.12 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0176166 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
220 aa  76.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
227 aa  76.3  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 
257 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0417  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  26.2 
 
 
216 aa  75.1  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.416805  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
273 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  30.73 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  34.12 
 
 
248 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  36.08 
 
 
253 aa  73.9  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  28.34 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5772  hypothetical protein  31.47 
 
 
270 aa  73.2  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.417059  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  29.6 
 
 
671 aa  72.4  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  28.37 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 
306 aa  72.4  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12910  protein-disulfide isomerase  26.71 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0652846  normal  0.0561302 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4282  DSBA oxidoreductase  32.77 
 
 
241 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
260 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  22.58 
 
 
246 aa  71.2  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 
671 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  27.71 
 
 
267 aa  71.2  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  29.82 
 
 
263 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  30.68 
 
 
671 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 
231 aa  70.1  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1857  DSBA oxidoreductase  31.03 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301144  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  26.51 
 
 
335 aa  70.5  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0715  putative thiol-disulfide oxidoreductase protein  24.02 
 
 
256 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0234364  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  23.08 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  22.49 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  28.3 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  34.76 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  32.88 
 
 
250 aa  68.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  27.17 
 
 
209 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 
217 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.19 
 
 
217 aa  67.8  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  27.38 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  28.43 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 
276 aa  67.8  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  31.01 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>