More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6044 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 257 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  91.39 
 
 		 257 aa  437  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  69.8 
 
 		 260 aa  374  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  66.54 
 
 		 259 aa  360  9e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  68.94 
 
 		 259 aa  353  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  69.43 
 
 		 259 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  48.84 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  50.19 
 
 		 255 aa  238  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  44.76 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  47.97 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  48.91 
 
 		 255 aa  230  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  47.66 
 
 		 255 aa  229  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  46.32 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  45.7 
 
 		 255 aa  219  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  44.2 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  50.22 
 
 		 254 aa  209  5e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  41.09 
 
 		 252 aa  202  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  46.37 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  41.99 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  41.99 
 
 		 265 aa  199  3.9999999999999996e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  45.62 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  42.86 
 
 		 263 aa  194  9e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  38.87 
 
 		 274 aa  192  4e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  41.13 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 255 aa  186  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  42.45 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  38.55 
 
 		 252 aa  174  1.9999999999999998e-42  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  38.55 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  41.35 
 
 		 253 aa  168  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  42 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  42 
 
 		 243 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  39.46 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  35.84 
 
 		 265 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  40.7 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  40.7 
 
 		 261 aa  157  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  36.16 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  36.16 
 
 		 247 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  38.86 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  35.56 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  39.71 
 
 		 250 aa  145  6e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  38.72 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  31.92 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  34.16 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  37.24 
 
 		 245 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  36.7 
 
 		 205 aa  128  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  34.2 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  36 
 
 		 209 aa  126  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  36.25 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 		 211 aa  120  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  34.36 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  35.58 
 
 		 222 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  33.48 
 
 		 263 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  35.62 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  37.72 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  40.74 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 228 aa  112  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  35.44 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  39.73 
 
 		 197 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  36.36 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 		 236 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7384  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 230 aa  109  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 265 aa  108  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 		 217 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6639  DSBA oxidoreductase  34.34 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100221 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  26.75 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  27.09 
 
 		 246 aa  106  4e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  34.48 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.92 
 
 		 204 aa  105  9e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.92 
 
 		 204 aa  105  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3906  DSBA oxidoreductase  34.83 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  102  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  33.71 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  35.53 
 
 		 233 aa  102  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  30.49 
 
 		 535 aa  101  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 		 204 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  29.05 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  29.39 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  35.46 
 
 		 210 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  35.4 
 
 		 210 aa  95.5  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1312  DsbA-like disulfide oxidoreductase  28.16 
 
 		 252 aa  95.1  1e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0500823  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  25.3 
 
 		 294 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  31.9 
 
 		 198 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  34.52 
 
 		 349 aa  92.4  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2607  DSBA oxidoreductase  26.8 
 
 		 249 aa  92  9e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  36.43 
 
 		 210 aa  91.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 		 348 aa  90.9  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 		 270 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 		 349 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  26.72 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  24.09 
 
 		 274 aa  88.6  9e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  27.43 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  31.25 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.43 
 
 		 270 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0881  DSBA oxidoreductase  31.76 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.498671 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  26.27 
 
 		 262 aa  82.8  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  30.12 
 
 		 207 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  30.12 
 
 		 207 aa  80.1  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>