250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3850 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  45.37 
 
 		 535 aa  168  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  37.24 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  38.67 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  43.75 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  35.32 
 
 		 254 aa  142  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  36.24 
 
 		 255 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  37.45 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 255 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 255 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 255 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  35.43 
 
 		 260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  37.1 
 
 		 247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  33.85 
 
 		 259 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  34.22 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  32.17 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  32.17 
 
 		 265 aa  128  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  31.6 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  31.6 
 
 		 252 aa  125  7e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  33.94 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 		 266 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  31.19 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.68 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 252 aa  111  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  37.79 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  42.95 
 
 		 205 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  33.96 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.65 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  30.97 
 
 		 247 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  31.62 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  31.62 
 
 		 261 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  30.53 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 248 aa  107  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  30.59 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 250 aa  103  4e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  31.19 
 
 		 274 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 245 aa  98.6  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  29.12 
 
 		 255 aa  98.2  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  29.03 
 
 		 265 aa  95.5  8e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  31.8 
 
 		 255 aa  94  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  25.1 
 
 		 263 aa  92.4  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 		 209 aa  92.4  7e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  32.79 
 
 		 211 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 209 aa  90.1  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 210 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 211 aa  89.4  6e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.06 
 
 		 211 aa  87.8  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 252 aa  87  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0018  DSBA oxidoreductase  32.99 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.445672 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  30.63 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 252 aa  82.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  29.38 
 
 		 222 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  29.01 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.08 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.08 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  30.29 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  32.03 
 
 		 211 aa  77.8  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  32.18 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1504  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.146939  normal  0.747814 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35.03 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  33.73 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  24.91 
 
 		 272 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0607  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.574613 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  23.63 
 
 		 274 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  29.93 
 
 		 197 aa  75.1  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 349 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 		 204 aa  75.1  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  28.16 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  25.88 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1352  DSBA oxidoreductase  30.25 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  20.63 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  25.23 
 
 		 250 aa  72.8  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1783  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 228 aa  72  0.000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.277988  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  20.63 
 
 		 294 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  20.63 
 
 		 270 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  26.64 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1504  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.844939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  31.65 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  29.22 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.91 
 
 		 664 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  32.5 
 
 		 671 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 671 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 		 671 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  26.54 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  28.17 
 
 		 652 aa  68.9  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1666  Na+/H+ antiporter NhaA  31.45 
 
 		 652 aa  68.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>