More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3349 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 238 aa  488  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1190  suppressor for copper-sensitivity C  50.21 
 
 		 207 aa  242  5e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1210  copper sensitivity supression protein  50.21 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.822664  normal  0.622691 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1225  copper sensitivity supression protein  50.21 
 
 		 207 aa  241  7e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.724279 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1074  suppressor for copper-sensitivity C  49.79 
 
 		 207 aa  241  7.999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1179  copper sensitivity supression protein  49.79 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3004  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.159469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0115  DSBA oxidoreductase  32.09 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0538996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4356  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 294 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04861  hypothetical protein  33.62 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4152  DSBA oxidoreductase  28.87 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3549  DsbA oxidoreductase  33.18 
 
 		 272 aa  135  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.421671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4224  DSBA oxidoreductase  30.7 
 
 		 294 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001108  secreted protein suppressor for copper-sensitivity ScsC  32.63 
 
 		 238 aa  133  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.269986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1379  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.99 
 
 		 242 aa  132  6e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  35 
 
 		 255 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  35.22 
 
 		 252 aa  128  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  35.22 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2720  DSBA oxidoreductase  33.92 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  34.85 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0760  putative suppressor for copper-sensitivity C precursor  36.46 
 
 		 216 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3499  DSBA oxidoreductase  34.05 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.511327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  32.16 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  32.73 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  32.57 
 
 		 259 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  30.64 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3199  DSBA oxidoreductase  33.14 
 
 		 244 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 		 243 aa  116  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  32.9 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  32.47 
 
 		 257 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  35.22 
 
 		 253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  35.16 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  29.15 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  33.18 
 
 		 257 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  32.61 
 
 		 255 aa  112  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  31.84 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1750  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0404971  normal  0.241511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 263 aa  105  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  29 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0905  putative outer membrane protein  28.33 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.787524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0909  outer membrane protein, putative  28.33 
 
 		 265 aa  103  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1790  outer membrane protein  29.18 
 
 		 274 aa  102  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2271  DSBA oxidoreductase  29.9 
 
 		 268 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.112284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 275 aa  98.6  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 269 aa  98.6  7e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0763  thioredoxin domain-containing protein  24.4 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  31.58 
 
 		 247 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  32.5 
 
 		 245 aa  96.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0955  DSBA oxidoreductase  32.37 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.616231  hitchhiker  0.0061431 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4310  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 262 aa  95.9  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.387734  hitchhiker  0.000746831 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1819  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 250 aa  92.4  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.621459  normal  0.210082 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1627  DSBA oxidoreductase  27.49 
 
 		 247 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2981  putative protein-disulfide isomerase  26.51 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241141  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  32.28 
 
 		 210 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  34.44 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1860  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 247 aa  90.1  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  35.26 
 
 		 211 aa  89.7  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  26.67 
 
 		 246 aa  89.7  4e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 210 aa  88.2  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  31.05 
 
 		 209 aa  86.3  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  29.49 
 
 		 261 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  29.49 
 
 		 261 aa  85.9  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  26.09 
 
 		 246 aa  84.3  0.000000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1713  DSBA oxidoreductase  27.18 
 
 		 252 aa  83.6  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0344853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  31.22 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3688  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 211 aa  81.6  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0968997 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  30.05 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0229  DSBA oxidoreductase  29.77 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.12077  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 		 197 aa  79.7  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.9 
 
 		 335 aa  79.3  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.68 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0901  disulfide oxidoreductase  24.15 
 
 		 257 aa  78.2  0.0000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00296205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  27.62 
 
 		 664 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0474  DSBA oxidoreductase  29.51 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0844568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  26.98 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  28.4 
 
 		 233 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  28.22 
 
 		 349 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2538  DSBA oxidoreductase  25.73 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.171459  normal  0.017866 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.42 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3170  DSBA oxidoreductase  28.04 
 
 		 535 aa  74.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0578033  normal  0.438922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.42 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 205 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0031  hypothetical protein  27.07 
 
 		 281 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.115246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  29.19 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  31.79 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  26.99 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  25.43 
 
 		 248 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 349 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  29.83 
 
 		 226 aa  71.6  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>