246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0414 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 218 aa  454  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  45.28 
 
 		 208 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  46.7 
 
 		 213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  46.11 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  41.15 
 
 		 218 aa  179  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  50 
 
 		 204 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 219 aa  158  6e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  40.49 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  39.41 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  31.8 
 
 		 219 aa  116  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  30.46 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  32.57 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 		 234 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  29.05 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  27.56 
 
 		 313 aa  88.2  8e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  28.77 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  27.14 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  34.93 
 
 		 630 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  30 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  29.38 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  29.8 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  29.48 
 
 		 174 aa  78.6  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  29.85 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  27.85 
 
 		 265 aa  78.2  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.2 
 
 		 349 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 		 349 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 		 671 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.46 
 
 		 671 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 335 aa  75.5  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  24.67 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  34.46 
 
 		 671 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3850  DSBA oxidoreductase  32.1 
 
 		 253 aa  71.6  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 263 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  29.27 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  28.72 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  28.64 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  28.18 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 		 281 aa  68.2  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  28.18 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  33.13 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  30.94 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  28.89 
 
 		 354 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  32.41 
 
 		 876 aa  66.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  28 
 
 		 664 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 265 aa  65.5  0.0000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  24.22 
 
 		 263 aa  64.7  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  27.84 
 
 		 172 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  31.01 
 
 		 336 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  28.99 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  27.54 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  29.75 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  26.06 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  31.33 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  31.55 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  28.93 
 
 		 248 aa  62.8  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  28.21 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  27.03 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  28.12 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  25.65 
 
 		 221 aa  62  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  28.66 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  27.07 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 		 409 aa  61.6  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.61 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  26.71 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  26.71 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  29.41 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  27 
 
 		 553 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  23.16 
 
 		 259 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  28.24 
 
 		 275 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  23.16 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0519  vitamin K epoxide reductase  23.67 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.539324  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  26.67 
 
 		 624 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.49 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  23.16 
 
 		 259 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  26.15 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  26.15 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  28.29 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  27.67 
 
 		 311 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>