295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1060 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 409 aa  836    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 228 aa  88.6  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  24.38 
 
 		 553 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  28.08 
 
 		 307 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 664 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  27.71 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 173 aa  72.4  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  33.78 
 
 		 197 aa  70.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  27.66 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 349 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  32.89 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 296 aa  68.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.82 
 
 		 624 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  28.92 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  27.97 
 
 		 204 aa  67.8  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0098  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  31.54 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  30.71 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  31.58 
 
 		 671 aa  67.4  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  28.07 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 671 aa  67  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  30.92 
 
 		 671 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  30.46 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  29.11 
 
 		 222 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0476  Disulfide bonded thioredoxin protein  28.19 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0293  disulfide oxidoreductase  26.83 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1010  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.057013  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  28.31 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  30.26 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  31.13 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0710  DSBA oxidoreductase  24.43 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  28.67 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  25.93 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1733  DSBA oxidoreductase  27.64 
 
 		 252 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690258  normal  0.0758369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0129  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 211 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.266261  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.42 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 313 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 230 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0134  DSBA oxidoreductase  31.08 
 
 		 210 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.631277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  25.79 
 
 		 265 aa  62.4  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  26.42 
 
 		 252 aa  62.4  0.00000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  27.59 
 
 		 224 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  27.85 
 
 		 616 aa  62.4  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  23.08 
 
 		 218 aa  61.6  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4908  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.771858 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 263 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  27.81 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 243 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1120  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 237 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  26.51 
 
 		 876 aa  61.6  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1539  DSBA oxidoreductase  29.87 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4361  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00151652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  30.34 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  30.11 
 
 		 281 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  27.74 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  25.74 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  24.69 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  26.19 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0366  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.81 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  24.71 
 
 		 261 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  24.71 
 
 		 261 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3248  DSBA oxidoreductase  27.93 
 
 		 226 aa  59.7  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0322461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  22.84 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0122  DSBA oxidoreductase  29.53 
 
 		 211 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0339396 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0381  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  25.81 
 
 		 204 aa  58.9  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0524  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 		 201 aa  58.9  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  26.76 
 
 		 219 aa  59.3  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 276 aa  59.7  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2833  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.483213 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0086  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2289  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  29.86 
 
 		 173 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3097  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0590  thiol:disulfide interchange protein  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6264  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 212 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  29.33 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2428  DSBA oxidoreductase  30.2 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.53532  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0353  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1999  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684259  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4245  DSBA oxidoreductase  26.95 
 
 		 210 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.354657 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0428  Thiol:disulfide interchange protein dsbA precursor  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  26.04 
 
 		 600 aa  58.9  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  25.25 
 
 		 221 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0408  thiol:disulfide interchange protein DsbA  23.84 
 
 		 212 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.358147  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  24 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2970  DSBA oxidoreductase  24.42 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.4 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  27.88 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  27.45 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>