250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3958 on replicon NC_009957
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 219 aa  435  1e-121  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  47.47 
 
 		 218 aa  191  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  54.55 
 
 		 204 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  47.22 
 
 		 212 aa  179  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  38.79 
 
 		 208 aa  179  4e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  50.56 
 
 		 221 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  40.76 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  44.79 
 
 		 228 aa  151  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  37.04 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  34.18 
 
 		 219 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 219 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 227 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  34.05 
 
 		 224 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  38.89 
 
 		 219 aa  98.6  7e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  30.81 
 
 		 313 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  33 
 
 		 228 aa  95.5  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  38.22 
 
 		 174 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  34.84 
 
 		 235 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  35.84 
 
 		 220 aa  92.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  37.16 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 		 219 aa  91.3  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  33.15 
 
 		 214 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  39.74 
 
 		 248 aa  86.3  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 229 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  31.88 
 
 		 230 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  32.2 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 		 227 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  32.84 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  32.14 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  34.38 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  30.17 
 
 		 288 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  32.65 
 
 		 270 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.54 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  29.88 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  29.88 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  34.3 
 
 		 630 aa  68.6  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5236  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.322706 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4714  DSBA oxidoreductase  31.48 
 
 		 273 aa  68.6  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0528991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  29.88 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1824  DSBA oxidoreductase  29.63 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412379  normal  0.303967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  30.56 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.03 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.73 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  28.35 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1905  DSBA oxidoreductase  33.68 
 
 		 296 aa  65.1  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0767  DSBA oxidoreductase  32.65 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.214179  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1805  hypothetical protein  25.95 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1806  hypothetical protein  25.95 
 
 		 261 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  28.38 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  32.19 
 
 		 243 aa  63.2  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0741  DSBA oxidoreductase  29.08 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.486242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  29.78 
 
 		 263 aa  62.8  0.000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  26.99 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  28.97 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  28.08 
 
 		 624 aa  61.6  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  29.41 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  32.03 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0829  DSBA oxidoreductase  26.2 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0169227 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  27.01 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  26.97 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  29.8 
 
 		 311 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  27.88 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.78 
 
 		 876 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  31.41 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1170  DSBA oxidoreductase  30.72 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1523  protein-disulfide isomerase  32.72 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0127931  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 276 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  26.45 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  28.83 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  29.68 
 
 		 260 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 263 aa  58.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0515  DSBA oxidoreductase  29.34 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.498642 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  32 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  27.27 
 
 		 311 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  29.03 
 
 		 664 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  29.8 
 
 		 600 aa  57  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3494  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1603  DSBA oxidoreductase  32.45 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.087263 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7654  DsbA oxidoreductase  30.12 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0601278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0158  DSBA oxidoreductase  24.59 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00718984 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0746  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.524858  normal  0.916851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1073  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3349  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  31.79 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4980  DSBA oxidoreductase  31.82 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0891302  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  29.09 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  28.65 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>