258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1716 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  51.6 
 
 
234 aa  195  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  45.41 
 
 
224 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  50.68 
 
 
228 aa  190  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  46.38 
 
 
235 aa  189  4e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  49.55 
 
 
227 aa  185  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  49.55 
 
 
313 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  48.18 
 
 
219 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  48.64 
 
 
219 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  48.64 
 
 
219 aa  180  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  48.64 
 
 
219 aa  180  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  58.9 
 
 
223 aa  177  9e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  47.95 
 
 
221 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  47.95 
 
 
221 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  47.49 
 
 
219 aa  174  9e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  54.71 
 
 
174 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  57.14 
 
 
237 aa  168  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  47.76 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  46.74 
 
 
220 aa  164  8e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  40.79 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  51.63 
 
 
230 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  40.09 
 
 
214 aa  150  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  40.99 
 
 
214 aa  148  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  43.94 
 
 
227 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  39.33 
 
 
228 aa  137  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  33.04 
 
 
242 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.72 
 
 
349 aa  97.4  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
348 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
349 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  36.42 
 
 
624 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 
218 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  34.88 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.24 
 
 
253 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  31.87 
 
 
335 aa  92.4  5e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  31.4 
 
 
265 aa  92  7e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 
219 aa  91.3  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  28.1 
 
 
240 aa  91.7  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  34.3 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  35.05 
 
 
553 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  31.15 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  35.21 
 
 
307 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  40.52 
 
 
616 aa  87.4  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  34.38 
 
 
221 aa  87  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  29.11 
 
 
213 aa  86.3  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  29.96 
 
 
217 aa  85.9  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.63 
 
 
339 aa  85.5  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
671 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  33.16 
 
 
671 aa  85.1  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  33.74 
 
 
173 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  33.75 
 
 
664 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  35.33 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  32.02 
 
 
212 aa  83.2  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
241 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.16 
 
 
671 aa  82  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  27.33 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  30.12 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1733  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 
231 aa  79.3  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  35.62 
 
 
311 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  37.35 
 
 
172 aa  79  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  28.63 
 
 
219 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  31.55 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  28.63 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  30.29 
 
 
232 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  30.48 
 
 
255 aa  78.2  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  39.39 
 
 
188 aa  77.8  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  28.63 
 
 
217 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  29.76 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  35.14 
 
 
268 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4758  hypothetical protein  30.95 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000311351  hitchhiker  1.34293e-20 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0598  hypothetical protein  29.76 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000289982  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0618  hypothetical protein  29.76 
 
 
216 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0148247  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
311 aa  75.9  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0452  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  30.95 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000602579  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.45 
 
 
354 aa  75.5  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
263 aa  75.1  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  37.84 
 
 
196 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 
281 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  35.76 
 
 
876 aa  73.9  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0459  DSBA oxidoreductase  26.87 
 
 
217 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00499597  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  36.42 
 
 
652 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  29.17 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0580  hypothetical protein  29.76 
 
 
216 aa  72  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00216301  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  30 
 
 
218 aa  72  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.95 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  34.67 
 
 
182 aa  70.5  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1143  DSBA oxidoreductase  30.61 
 
 
221 aa  70.5  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0385378 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
263 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  31.94 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  35.37 
 
 
600 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1482  DSBA oxidoreductase  23.66 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>