239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4572 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
237 aa  478  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  64.74 
 
 
174 aa  221  6e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  53.96 
 
 
234 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  59.54 
 
 
219 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  57.71 
 
 
221 aa  198  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  49.55 
 
 
227 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  57.71 
 
 
221 aa  198  5e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  49.55 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  50.23 
 
 
229 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  56.07 
 
 
228 aa  192  4e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  56.9 
 
 
219 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  56.9 
 
 
219 aa  191  6e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  48.85 
 
 
219 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  56.9 
 
 
219 aa  191  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  58.18 
 
 
230 aa  186  2e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  51.26 
 
 
223 aa  184  9e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  46.61 
 
 
235 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  46.85 
 
 
214 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  46.85 
 
 
214 aa  174  9.999999999999999e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  47.49 
 
 
224 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  42.59 
 
 
227 aa  169  4e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  47.42 
 
 
226 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  41.26 
 
 
219 aa  159  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  47.19 
 
 
220 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  37.1 
 
 
228 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  39.02 
 
 
243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  34.57 
 
 
265 aa  98.2  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  32.11 
 
 
265 aa  98.2  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  34.11 
 
 
253 aa  97.1  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  34.16 
 
 
553 aa  95.9  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  32.48 
 
 
219 aa  92.8  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.91 
 
 
247 aa  91.7  8e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  33.97 
 
 
275 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  36.25 
 
 
624 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 
348 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  31.33 
 
 
349 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  34.57 
 
 
221 aa  89.4  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  31.93 
 
 
349 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  28.1 
 
 
213 aa  87  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  30.09 
 
 
212 aa  86.7  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  32.72 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.3 
 
 
255 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  33.5 
 
 
616 aa  85.1  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  29.21 
 
 
218 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  35.76 
 
 
335 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  36.73 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  36.36 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  27.68 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  33.54 
 
 
179 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
336 aa  81.6  0.000000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
268 aa  81.6  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  31.18 
 
 
354 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  33.71 
 
 
671 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  34.29 
 
 
671 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  33.33 
 
 
671 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  30.22 
 
 
335 aa  79.7  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  30.9 
 
 
218 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
232 aa  79.3  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  33.67 
 
 
876 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  33.33 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
182 aa  77.4  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  31.61 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  25.97 
 
 
208 aa  75.9  0.0000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  32.24 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  30.99 
 
 
182 aa  75.1  0.0000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  33.53 
 
 
196 aa  75.5  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  29.63 
 
 
613 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  30.43 
 
 
339 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  29.63 
 
 
613 aa  73.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  29.63 
 
 
613 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  32.9 
 
 
664 aa  72.4  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  28.18 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  34.38 
 
 
248 aa  72  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 
263 aa  72.4  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2416  DSBA oxidoreductase  38.36 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.726632  normal  0.0122921 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.3 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  39.29 
 
 
188 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  37.57 
 
 
652 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 
173 aa  69.3  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2375  DSBA oxidoreductase  35.98 
 
 
298 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  31.15 
 
 
600 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0655  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
219 aa  67  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.623991 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  32.14 
 
 
311 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2523  DSBA oxidoreductase  32.17 
 
 
281 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.567201 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4951  DSBA oxidoreductase  36.18 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.120355  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  33.12 
 
 
270 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  31.79 
 
 
398 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0538  Vitamin K epoxide reductase  30 
 
 
390 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.380465  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3392  DSBA oxidoreductase  33.57 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.536541  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0863  DSBA oxidoreductase  30.28 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00216121  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
293 aa  65.1  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0505  vitamin K epoxide reductase  31.01 
 
 
411 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0534  Vitamin K epoxide reductase  29.33 
 
 
390 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  28.97 
 
 
617 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  31.49 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.54274 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>