257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5606 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  100 
 
 
221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  96.35 
 
 
219 aa  417  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  67.89 
 
 
219 aa  290  1e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  67.89 
 
 
219 aa  290  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  67.89 
 
 
219 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  66.51 
 
 
219 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  62.15 
 
 
227 aa  273  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  62.44 
 
 
313 aa  271  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  63.38 
 
 
228 aa  270  9e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  62.1 
 
 
234 aa  268  5e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  53.46 
 
 
214 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  58.38 
 
 
214 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  49.76 
 
 
229 aa  197  7e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  57.71 
 
 
237 aa  197  9e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  53.49 
 
 
235 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  52.6 
 
 
224 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  47.87 
 
 
230 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  50.53 
 
 
220 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  54.07 
 
 
223 aa  175  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  52.3 
 
 
174 aa  174  8e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  44.39 
 
 
219 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  48.17 
 
 
226 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  41.83 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  39.05 
 
 
228 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  34.69 
 
 
219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  35.38 
 
 
212 aa  107  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  37.09 
 
 
204 aa  102  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  35.9 
 
 
243 aa  100  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  36.05 
 
 
335 aa  97.8  1e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  31.37 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3981  DSBA oxidoreductase  29.61 
 
 
253 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.670573 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1148  DSBA oxidoreductase  33.93 
 
 
265 aa  93.2  3e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0375091 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  37.11 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  37.06 
 
 
624 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  27.94 
 
 
240 aa  92.8  4e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  27.32 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  37.34 
 
 
182 aa  90.1  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4060  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
348 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  24.64 
 
 
208 aa  88.6  6e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  34.9 
 
 
265 aa  88.2  9e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4093  DSBA oxidoreductase  34.27 
 
 
349 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.158731  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3950  DsbA oxidoreductase  32.87 
 
 
349 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1371  protein-disulfide isomerase-like protein  32.3 
 
 
275 aa  87  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512305  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  31.68 
 
 
213 aa  86.7  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  33.55 
 
 
336 aa  86.7  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4192  DSBA oxidoreductase  37.93 
 
 
671 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4165  DSBA oxidoreductase  37.93 
 
 
671 aa  85.9  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  32.84 
 
 
553 aa  85.5  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1150  DSBA oxidoreductase  30.77 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.132027 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4447  DSBA oxidoreductase  41.26 
 
 
173 aa  85.5  6e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3327  DSBA oxidoreductase  31.56 
 
 
255 aa  84.7  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  28.57 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  31.47 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  39.16 
 
 
876 aa  84.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  40.56 
 
 
616 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4049  DsbA oxidoreductase  37.93 
 
 
671 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  35.51 
 
 
179 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0475  DSBA oxidoreductase  35 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.847583  normal  0.628635 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0142  DSBA oxidoreductase  35.57 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0380  DSBA oxidoreductase  34.72 
 
 
664 aa  79.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.4471  normal  0.0162028 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  29.33 
 
 
262 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  33.54 
 
 
630 aa  78.6  0.00000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0503  DSBA oxidoreductase  28.32 
 
 
232 aa  78.6  0.00000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000346108  hitchhiker  0.00000423738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0579  hypothetical protein  30.56 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1217  DSBA oxidoreductase  33.77 
 
 
263 aa  78.2  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.364209  normal  0.993383 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 
173 aa  77.4  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3229  DSBA oxidoreductase  33.76 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0475  Na+/H+ antiporter NhaA  33.78 
 
 
613 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0486  Na+/H+ antiporter NhaA  33.78 
 
 
613 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.913429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0497  Na+/H+ antiporter NhaA  33.78 
 
 
613 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.573213 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0747  DSBA oxidoreductase  32.87 
 
 
335 aa  75.1  0.0000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.93701  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3537  protein-disulfide isomerase-like protein  32.93 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  25.11 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3126  vitamin K epoxide reductase  36.05 
 
 
398 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3641  DsbA oxidoreductase  30 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  32.05 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  31.94 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3699  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
311 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.667641  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3782  DSBA oxidoreductase  31.52 
 
 
311 aa  71.6  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0253  DSBA oxidoreductase  30.86 
 
 
241 aa  71.6  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0163  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30.17 
 
 
270 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4506  DSBA oxidoreductase  33.11 
 
 
248 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.175214  normal  0.823717 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 
267 aa  70.5  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1985  DSBA oxidoreductase  29.94 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.025834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  33.77 
 
 
600 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.21 
 
 
293 aa  69.3  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0667  Na+/H+ antiporter NhaA  33.79 
 
 
617 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.74457  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0610  DSBA oxidoreductase  27.98 
 
 
246 aa  68.9  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0894  DSBA oxidoreductase  37.58 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1775  DSBA oxidoreductase  26 
 
 
263 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1566  DSBA oxidoreductase  28.36 
 
 
227 aa  68.2  0.00000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0178633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  32.03 
 
 
257 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2570  DSBA oxidoreductase  33.12 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.649073  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  33.33 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1658  Na+/H+ antiporter NhaA  38.46 
 
 
652 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.245406 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1060  DSBA oxidoreductase  29.58 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.533391  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  32.08 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1537  Na+/H+ antiporter NhaA  30.92 
 
 
624 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>