245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1440 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1440  DsbA oxidoreductase  100 
 
 		 208 aa  432  1e-120  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0414  DSBA oxidoreductase  45.28 
 
 		 218 aa  207  9e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3620  DSBA oxidoreductase  38.79 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.512304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3958  DSBA oxidoreductase  38.79 
 
 		 219 aa  179  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.176467  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2700  dsbA-like thioredoxin domain-containing protein  43 
 
 		 213 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0515497  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2159  DsbA oxidoreductase  43.75 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324479 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4133  DSBA oxidoreductase  37.09 
 
 		 218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1646  disulfide isomerase-like protein  38.5 
 
 		 204 aa  159  4e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.416109 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3277  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.57379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3286  DSBA oxidoreductase  36.9 
 
 		 228 aa  137  7.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0691509  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0173  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2484  DSBA oxidoreductase  26.79 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215444  normal  0.166182 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0187  DSBA oxidoreductase  28.75 
 
 		 220 aa  90.5  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000166477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2802  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 219 aa  84.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25860  protein-disulfide isomerase  32.24 
 
 		 174 aa  84.3  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5684  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287578 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3690  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5326  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.950308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5404  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.615827  normal  0.445514 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5606  DSBA oxidoreductase  24.64 
 
 		 221 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2828  DSBA oxidoreductase  25.94 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.208498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2663  DSBA oxidoreductase  26.14 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2628  DSBA oxidoreductase  27.1 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0673333  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3281  DSBA oxidoreductase  30.82 
 
 		 263 aa  73.9  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.101876  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0908  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11860  protein-disulfide isomerase  26.01 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2927  DSBA oxidoreductase  27.4 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.54274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  23.84 
 
 		 624 aa  72  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4977  Protein-disulfide isomerase-like protein  25 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1468  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 313 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1491  DSBA oxidoreductase  26.42 
 
 		 227 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3237  DSBA oxidoreductase  27.04 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1716  DSBA oxidoreductase  27.33 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127948  normal  0.514316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1661  DSBA oxidoreductase  30.06 
 
 		 275 aa  70.5  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.148876  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0613  DSBA oxidoreductase  27.34 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00263704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0062  DSBA oxidoreductase  30.41 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.381736 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4443  DSBA oxidoreductase  26.77 
 
 		 229 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.540648  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4572  DSBA oxidoreductase  25.97 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3517  Na+/H+ antiporter NhaA  30.12 
 
 		 630 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.761621 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3948  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0375371  normal  0.31258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3685  putative disulfide bond formation protein D precursor (disulfide oxidoreductase D)  28.28 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0106163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1822  DSBA oxidoreductase  30.13 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4209  hypothetical protein  30.07 
 
 		 254 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3655  DSBA oxidoreductase  28.03 
 
 		 259 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0622  twin-arginine translocation pathway signal  31.72 
 
 		 233 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0030  putative thiol-disulfide oxidoreductase D  24.43 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362131  normal  0.0119796 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4235  DSBA oxidoreductase  26.62 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0895596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0115  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.31 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  29.14 
 
 		 293 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1464  periplasmic thiol-disulphide interchange protein  28.31 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.336066  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0730  DSBA oxidoreductase  28.4 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.22688 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3787  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.117786  normal  0.763789 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3941  DSBA oxidoreductase  27.39 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0405057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  26.11 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4198  DSBA oxidoreductase  28.97 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2185  DSBA oxidoreductase  28.74 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.829499  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4063  DSBA oxidoreductase  30.54 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5427  DSBA oxidoreductase  26.85 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.878245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4299  twin-arginine translocation pathway signal  31.03 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  22.22 
 
 		 616 aa  65.5  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0444  DSBA oxidoreductase  23.68 
 
 		 335 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6044  DSBA oxidoreductase  26.17 
 
 		 257 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.680515  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2114  outer membrane protein  26.32 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.155557  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0209  outer membrane protein  26.32 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00342599  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0496  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.57 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2172  DSBA oxidoreductase  24.31 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2862  DSBA oxidoreductase  27.22 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.898425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1348  DSBA oxidoreductase  25 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4114  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0799  vitamin K epoxide reductase  26.83 
 
 		 553 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2703  DSBA oxidoreductase  26.21 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0600597  normal  0.0595664 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 		 876 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4108  DSBA oxidoreductase  29.81 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1214  DSBA oxidoreductase  28.29 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.734825  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0019  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00000575449  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0612  DSBA oxidoreductase  28.86 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.862805  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0529  DSBA oxidoreductase  26.53 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000014473 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3648  DSBA oxidoreductase  21.95 
 
 		 339 aa  59.7  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.452438  normal  0.470316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2436  DSBA oxidoreductase  27.11 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.43203 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0499  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.57 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0561363  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3767  DSBA oxidoreductase  22.09 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2643  DsbA family thiol:disulfide interchange protein  25.99 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3013  DSBA oxidoreductase  24.07 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0456  thiol-disulfide oxidoreductase (disulfide bond formation protein D) (disulfideoxidoreductase D)  25.49 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000730709  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4989  Fis family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1102  hypothetical protein  27.39 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.983538  normal  0.0993738 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3405  thiol:disulfide interchange protein DsbA  26.22 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0513  hypothetical protein  25.49 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000298764  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0467  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00160991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0544  hypothetical protein  26.11 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00366e-53 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0544  hypothetical protein  25.49 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000359275  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2358  DSBA oxidoreductase  22.89 
 
 		 179 aa  58.2  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1270  DSBA oxidoreductase  27.78 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0360105  hitchhiker  0.00278647 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2412  DSBA oxidoreductase  23.49 
 
 		 182 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.213159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6579  DSBA oxidoreductase  27.61 
 
 		 336 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93463 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2771  DSBA oxidoreductase  23.97 
 
 		 243 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0360918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3016  DSBA oxidoreductase  28.48 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.517861  normal  0.845616 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3635  DSBA oxidoreductase  25.17 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.874564  hitchhiker  0.000658769 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4143  DSBA oxidoreductase  26.9 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3792  DSBA oxidoreductase  27.5 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.344865  normal  0.0187029 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>